【摘 要】
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研究目的对2017-2019年河南省漯河市SARI病例标本进行回顾性分析并进行前瞻性研究,通过对标本中HRV的检测、鉴定和分析,明确河南省漯河市SARI病例中HRV的流行状况、临床特征、血清型分布以及相关血清型的全基因组特征,为河南省HRV的相关研究积累基础数据,并为HRV的诊断和防控提供科学依据。研究方法收集2017年10月至2019年6月河南省漯河市中心医院住院SARI病例的咽拭子标本。采用R
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研究目的对2017-2019年河南省漯河市SARI病例标本进行回顾性分析并进行前瞻性研究,通过对标本中HRV的检测、鉴定和分析,明确河南省漯河市SARI病例中HRV的流行状况、临床特征、血清型分布以及相关血清型的全基因组特征,为河南省HRV的相关研究积累基础数据,并为HRV的诊断和防控提供科学依据。研究方法收集2017年10月至2019年6月河南省漯河市中心医院住院SARI病例的咽拭子标本。采用Real-time RT-PCR对咽拭子标本进行HRV筛查,随后对HRV 阳性标本采用nested PCR对VP1区靶基因序列进行扩增,并将扩增产物进行序列测定。将获得的序列与Genbank上下载的HRV各血清型原型株一起构建亲缘性关系树,并对检出率最高血清型选取代表株进行全基因组序列测定。使用Sequencher 5.4.5、MEGA 5.05和BioEdit 7.0.5等软件对序列进行拼接、比对和亲缘性关系等分析。研究结果(1)在2017-2019年河南省漯河市住院SARI病例标本中共检出HRV 阳性标本73例,检出率为7.19%,在呼吸道病毒中检出率位于第六位。(2)HRV 阳性标本中成功获得65份VP1区靶基因序列,共包含41个不同血清型,其中两个血清型建议划分为新血清型Bpat107和Cpat58。分析发现HRV-A中检出率最高血清型为A104;HRV-C中检出率最高血清型为C2。(3)河南省HRV的检出在夏季和秋季出现高峰,有明显的季节分布趋势;HRV-C的流行高峰较HRV-A相比有所推迟,且峰值比HRV-A低。(4)河南省HRV各血清型的流行模式不尽相同,有些血清型如A104在较短时间集中被检出;有些血清型如A82在连续的年份均有检出;有些血清型如A80在间隔的年份有检出。(5)研究显示在全球范围内大部分的HRV血清型一直处于流行状态,但有小部分的血清型已逐渐不再流行;并且全球HRV血清型的分布上出现了地域局限性。(6)基于VP4/2区对HRV-A104进行分析,本研究将HRV-A104划分为ABC三个基因型,本研究获得的序列在C基因型中单独构成了 LH-lineage,且HRV-A104不同型别间在时间和地域分布上有差异。(7)对HRV-A104的VP4/2区和VP1区序列进行氨基酸位点变异分析,发现与原型株JN562727/USA/2009相比在VP4/2区有5个氨基酸位点发生了变异,且所有B基因型序列与原型株相比第106位氨基酸发生了变化,由V变成了 I;在VP1区有22个氨基酸位点发生了变异,本研究中的序列位于LH-lineage,在第91位氨基酸位点与原型株相比所有的D变成了 E。研究结论(1)HRV是严重急性呼吸道感染中的重要病毒病原体,在此批标本中检出率位于第六位。(2)HRV血清型数量众多,在本研究中共鉴定出41个不同血清型,其中两个血清型建议划分为新血清型;提示我们HRV变异大,应加强对HRV的监测。(3)HRV中以HRV-A和C为主,HRV-A中检出率最高血清型为A104,HRV-C中检出率最高血清型为C2。(4)研究发现HRV-A104在河南省2017-2019年间发生过小范围的流行,将HRV-A104划分ABC三个基因型,本研究中的序列在进化树C基因型上构成了LH-lineage,提示与其它序列相比,本研究中的HRV-A104发生了进化。(5)HRV在全球范围内广泛存在,但其各血清型在时间和地域分布上存在一定差异。图[25]表[41]参[63]
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