2010年1月1日,中国—东盟自由贸易区(CAFTA)正式建成,标志着中国与东盟双方正式步入自贸区时期,经贸关系得到了较大提升。但是,随着中国与部分东盟成员国领土争端问题的激化、全球金融危机爆发后世界经济复苏缓慢以及亚太政治安全环境的恶化,中国与东盟间的经贸关系面临了众多内部威胁和外力挑战。本文分析了在自贸区时期,中国与东盟间的经贸关系发展所存在的两大问题：中国与东盟经贸关系发展存在贸易投资不平衡的问题;中国与东盟经贸关系发展存在竞争加剧与摩擦加大的问题。接着,本文分别从中国—东盟自贸区内部、中国—东盟自贸区外部两个角度探讨了自贸区时期影响中国与东盟经贸关系发展的现实因素：从中国—东盟自贸区内部看包括东盟内部经济发展水平不平衡、东盟内部政局动荡、中国与东盟经济结构相似导致竞争性大于互补性、东盟针对中国实行贸易保护政策、自贸区内“中国威胁论”的影响、中国与东盟存在领土争端等；从中国—东盟自贸区外部看,一方面在于后金融危机时代发达国家经济受困对外寻求出路对中国与东盟合作关系造成冲击,另一方面美国“重返亚太”战略推行以及日本军国主义复苏给中国与东盟间的经贸关系发展环境带来了干扰。最后,本文依据上述所论问题,分别从针对中国—东盟自贸区内部和自贸区外部两个视角寻求破解未来中国与东盟在经贸关系发展中的瓶颈,从而促进双方经济的发展并为亚太乃至世界经济的复苏与繁荣作出贡献。中国与东盟是当前亚太乃至世界地区重要的经济与政治体,是未来世界经济复苏的重要力量,中国与东盟双方都应当认清历史与事实,充分尊重双方的国家利益,克服政治分歧,优化双方的经贸合作环境。同时,面对当前复杂的外部环境以及某些国家对双方关系的恶意破坏应当始终坚定互利互信的立场,否则将不利于双方经济与政治的往来与发展。