中国中西部9个地方绵羊品种mtDNA遗传多样性与系统进化研究

来源 :西北农林科技大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:cyanh77
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本研究从中国河南、陕西、甘肃和新疆等省、市自治区采集了河南大尾羊(HN,52 只)、汉中绵羊(HZ,50 只)、兰州大尾羊(LZ,42 只)、岷县黑裘皮羊(QP,48 只)、乔科羊(QK,56 只)、欧拉羊(OL,48 只)、甘加羊(GJ,47 只)、巴什拜羊(BSB,48 只)和塔什库尔干羊(TSK,47只)9 个地方品种,并在北京昌平基地羊场采集了外来纯种萨福克绵羊(SFK,30 只)作为对照。通过PCR-SSCP 及DNA 测序的方法对这些品种(共468 个体)线粒体DNA 编码区的Cytb、COI、ND2、ND4、12S rRNA 和16SrRNA 基因设计特异性引物进行多态性分析,并通过测序分析找出了导致多态的变异位点。首次利用D-loop 和Cytb 基因的全序列对我国的绵羊品种进行起源进化和多态性研究,结果如下: 1. 对于编码区基因PCR-SSCP 及DNA 测序的分析结果  1.1 在上述6 个基因上共设计了10 对特异性引物,结果5 对引物表现出多态性。在PCR-SSCP 分析的基础上据它们在带型上表现出的差异,分别命名为A、B和C 单倍型。中国9 个地方绵羊品种在除SP2 引物之外的其他4 个多态位点上存在A、B和C 三种单倍型,而且A 单倍型出现的频率高于B、C 单倍型。对于欧洲品种萨福克绵羊来说只存在A、B两种单倍型,且B 单倍型的频率高于A 单倍型的频率。1.2 SP2 位点只在萨福克绵羊中具有多态性,而在其他绵羊品种中没有多态性。通过进一步的测序分析发现,造成这种差异的原因是由于27(在COⅠ上的位置为252)位的碱基C←→T 间的突变造成。A 单倍型在此处为T 碱基,B单倍型在此处为C 碱基,SP2 位点可用来区别中国地方品种和外来品种。1.3 SP4 位点在除塔什库尔干绵羊和萨福克绵羊外的其他8 个品种中都表现出3 种单倍型。河南大尾羊、汉中绵羊和塔什库尔干绵羊在SP5 位点上存在A 和B两种单倍型,没有C 单倍型,而且C单倍型在其它几个绵羊品种中出现的概率也比较低。在SP9 位点上,汉中绵羊和萨福克绵羊没有多态性,兰州大尾羊存在A 和C 两种单倍型。相对于其它位点来说,SP10 位点的多态性较高。1.4 SP4、SP5、SP9 和SP10 位点在10 个绵羊品种中分别对32、25、47 和23 个个体进行了序列测定,结果:SP4 的核苷酸序列多样性为4.9%,其中155(T→C)、171(A→G)位点处的碱基替换为C 单倍型所特有,162(C→T)位点处的碱基替换为A 单倍型所特有,129(T→C)处的碱基替换为A、C 单倍型所共有。SP5 位点的核苷酸多样性为4.17%,195 位点处的碱基T→C
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