[目的]建立我国口岸常见蚊虫rDNA-ITS、COI基因数据库,以此实现蚊虫的分子鉴定,并基于各地区尖音库蚊复合组的COI基因建立溯源的分子基础。[方法1于2012年采集我国口岸常见蚊虫(淡色库蚊、致倦库蚊、三带喙库蚊、白纹伊蚊、中华按蚊、骚扰阿蚊),通过核酸提取、基因扩增、质粒载体构建和克隆测序、序列比对、构建系统发育树及多重PCR和凝胶电泳鉴定各蚊种；并分别对江苏各地区尖音库蚊mtDNA-COI基因进行测序,序列比对和系统发育树的构建,建立COI基因数据库。[结果]淡色库蚊、致倦库蚊、三带喙库蚊、白纹伊蚊、骚扰阿蚊可克隆获得差异的rDNA-ITS,其中野外淡色库蚊及实验室饲养的均为1273bp,三带喙库蚊的克隆片度大小为995bp,致倦库蚊为1314bp,白纹伊蚊为1197bp,骚扰阿蚊为1013bp,而中华按蚊未扩增出全长rDNA-ITS,仅扩增获到rDNA-ITS2片段；通过多重PCR产物凝胶电泳,可获得各蚊种的特异性电泳条带；并获得了连云港、常熟、张家港、盐城、泰州、徐州、南京、南通、无锡9个地区尖音库蚊mtDNA-COI基因型。[结论]通过对蚊虫rDNA-ITS的多重PCR可实现淡色库蚊、致倦库蚊、三带喙库蚊、白纹伊蚊、中华按蚊、骚扰阿蚊的种属鉴定；江苏地区间的尖音库蚊复合组COI基因序列存在差异,可通过该数据库的核酸信息追溯江苏地区蚊虫的来源。