中国未来的经济发展,不能离开科学发展和技术创新的强力支持,技术创新终将成为中国经济发展的重要动力和源泉。研究与开发活动作为技术科技进步的重要物质来源和基础,左右着企业和国家创新能力的高低。研发投入的多少表现了国家和地区对科技活动的重视程度,研发投入的产出反映了国家或地区的技术创新水平,进而决定着国家经济运行和增长的潜在能力。企业作为我国经济运行的主体,近些年在科技创新研发上的投入虽然实现逐年增长,但是所达到的研发投入强度仍然远远落后于其他发达国家,没有投入就没有产出,因而投入的力度不够是导致我国缺乏自主创新的主要原因。研究什么因素影响企业的R&D活动,这些影响因素又是通过什么机制影响企业研发的投入,各个因素的影响程度是多大的,就能使国家为企业R&D的支持管理实践提供侧重方向,也能为企业自身提供改进建议以促进研发,提高R&D资金投入运转效率,使创新活动更好地为企业服务,而且对我国企业的成长和提高国际竞争力也有着明显的作用。从目前的研究上看,研究大多是从宏观和微观两个层面探讨企业研发的影响因素,而多以某一个层面的具体单一因素进行研究,缺乏系统的多层面的研究研发的影响因素。在宏观上,各地区各市场的市场化的进程对企业研发的影响前人也较少的研究和讨论。本文首先从理论上描述了对研发产生影响的融资、股权性质、地区市场化进程对研发的影响机制和路径,并建立二阶段博弈论模型,用数理的方式推导了政府直接资助对企业研发的影响。同时根据理论结合已有文献的研究成果,构建了研发投入影响因素回归模型,试图从外部因素和内部因素两个层面探讨影响研发投入的主要因素及其影响程度。并以我国深证A股主板上市公司2009-2011年有披露研发数据的公司为研究样本,通过采用公开财务报表数据,对影响R&D投入的因素进行了多元线性回归,最后对实证研究结果进行分析。研究结果表明：规模、内源融资、债务融资、政府资助和地区市场化程度比例对R&D投入有显著影响。最后根据实证和理论研究的结论,对促进我国企业R&D投入提出了相关建议。