合作和冲突是广泛存在的社会现象。市场经济最本质的特征是冲突与竞争，冲突与竞争使资源得以合理的配置和有效率的使用，并且通过永不停止的创新推动着社会经济的发展。然而，冲突不是唯一的，极端的，企业要获得生存与发展，需要从环境当中谋求支持和机会，这就要从合作的角度去寻找答案。冲突与合作是辩证统一的。冲突分析与合作理论是市场竞争进入较高层次的标志，是现代管理科学中的重要内容之一。本文的研究目的是通过对冲突分析与合作理论进行系统全面的研究，力图建立一套冲突与合作分析理论的完整体系结构，并把它们扩展到实际应用当中去。为此本文力图进行一些创新性的研究工作，主要工作如下：1．通过对有关文献的研究，总结冲突分析与合作理论的国内外研究现状与其发展方向。2．研究冲突分析常用的模型与算法，着重分析了F-H方法与纳什均衡的缺陷与改进，提出了二步纳什均衡的概念；并研究了将冲突分析与粗糙集理论相结合，根据冲突函数的不同定义和阈值设定，导致不同联盟的方法。3．评述合作理论，并归结出合作理论的基本观点与主要内容，主要对中外合资企业的合作与其稳定性进行分析。4．研究分配问题，主要研究分配问题中的多人合作对策问题，合作对策模型的常用解法，特别是多目标规划，以及DEA与多目标决策解法等。并对分配问题进行了公理化研究 。5．研究冲突与合作中必然经历的过程--谈判的理论，对于谈判的理论模型,谈判中的冲突与调停合作进行了分析，着重研究供应链内谈判协调机制的设计与实现。6．研究了供应链管理中的冲突、合作与分配问题。从分配协调与库存协调为出发点尝试建立一套较为完善的库存合作利益分配协调机制，从而达到供需合作间双赢的目的。