随着经济一体化,世界各国之间的经济合作越来越紧密,贸易也越来越频繁,合作交流的同时,竞争也越来越激烈,对于银行业来说,更是如此。在如此激烈的竞争中,要立于不败之地,提高自身的效率显得尤为重要。首先找到自身的缺陷所在,然后,对症下药,才是良方。对于效率评价模型而言,指标的选取至关重要,本文在选取指标时,收集我国16家商业银行2004-2012年资产负债表和现金流量表的数据,基于现金增加值的思想,确定投入产出指标,保证了指标选取的客观性。另外,作为银行,由于其金融产品有其特殊性,风险与利润共存,因此在衡量效率的框架中,必须把风险纳入进去。本文在建立模型的过程中,将经营活动中产生的不良贷款作为非期望产出,建立SBM视窗分析模型,动态分析了我国商业银行的效率,并且与不考虑非期望产出的模型相比,结果发现考虑非期望产出后,银行的效率会降低,说明非期望产出对银行的效率是有影响的,在评价银行效率时,考虑非期望产出更为合理。在此基础上,本文进一步用Malmquist指数分析法,对我国商业银行效率进行差异性分析,结果表明,我国商业银行效率的低下,主要是由于技术进步不足导致的,因此技术进步是影响我国商业银行效率的不容忽视的因素。最后,重新收集数据,从规模、创新、稳定性、盈利能力、配置、公司治理以及股权结构等七个方面去考察影响银行效率的因素,利用面板Tobit模型对我国商业银行效率的影响因素进行分析,结果表明,商业银行的创新程度、银行的稳定性都能对商业银行的效率产生正面的积极影响,公司的代理成本,对银行的效率所起到的作用是负向的,因此商业银行应该严格控制成本管理,不断提高自身的创新能力,不断增强自身的稳定性。