论文部分内容阅读
三阴性乳腺癌(TNBC)是一类恶性程度高的乳腺癌。相对于其它类型的乳腺癌,TNBC呈现转移率高、复发率高与预后差等特征。目前缺乏特效的靶向药物来治疗TNBC。可变剪接是指真核生物基因转录pre-mRNA之后,内含子被切除,外显子通过不同的组合方式拼接,并形成可以编码不同蛋白产物的mRNA的过程。体内异常的剪接已成为肿瘤发生发展潜在的标志物。 我们的研究发现,相比于其它乳腺癌分型,TNBC呈现独特的剪接谱。进一步研究发现,作为神经退行性疾病中关键的病理性蛋白,TDP43能作为TNBC独特剪接谱的主要调控因子。生物信息分析与临床数据发现,TDP43在TNBC中高表达,而且其高表达与病人预后差相关。在TNBC细胞系中,敲低TDP43抑制细胞生长与迁移。同时,过表达TDP43促进永生化细胞生长与恶性程度。蛋白质谱与免疫共沉淀实验发现,TDP43能与另一个剪接因子SRSF3结合。转录组测序分析与体外报告载体实验显示TDP43与SRSF3形成的复合物能协同地调控TNBC细胞中可变剪接。类似于TDP43,敲降SRSF3同样能抑制TNBC肿瘤进程;同时敲降这两个剪接因子可以更大程度地抑制细胞生长与迁移。为了明晰TDP43与SRSF3如何调控乳腺癌进程,我们结合生物信息分析与文献报道鉴定了两个下游基因(PAR3和NUMB)的剪接事件。功能回补实验显示,敲低TDP43或SRSF3均能抑制PAR3外显子12的排除(△12PAR3)。在敲低TDP43或SRSF3细胞中,过表达PAR3外显子12排除形式的转录本能部分回补细胞转移能力。 我们的结果揭示了TNBC存在特异性剪接模式,这种剪接模式及其主要调控因子将可能作为TNBC潜在的治疗靶点。