羊POU1F1基因多态性及其与凉山半细毛羊体重性状的相关研究

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POU1F1(pituitary transcription factor 1)是被鉴定的第一个垂体转录因子,它对哺乳动物的生长发育、新陈代谢起重要的调节作用,具有提高生长速度,降低脂肪沉积等广泛的生物学功能。本实验根据绵羊POU1F1基因第2、3、5外显子和第4内含子序列设计6对引物(P1、P2、P3、P4、P5和P6)扩增LS、ZS、NBG、JDG、JBG和CMG 6个羊群体序列,用PCR-SSCP方法分析其多态性及其与凉山半细毛羊不同月龄体重(初生重、断奶重、断奶日增重、1.5岁体重和2.5岁体重)性状的相关性。所设计的6对引物中,POU1F1基因的第3外显子(P2扩增片段)在所研究的6个群体(LS、ZS、NBG、JDG、JBG和CMG)中均具有多态性,P4和P5扩增片段(内含子4部分序列)只在LS群体中具有多态性,P1、P3和P6扩增片段在所研究的6个群体中都没有发现多态性。P2扩增片段在LS、JDG、JBG和NBG群体中共检测到三种基因型,分别定义为DD、DE和EE,在ZS和CMG群体中只检测到2种基因型(DD和EE),所选的6个群体均以DD为优势基因型;引物P4扩增片段在LS中也检测到3种基因型,分别定义为AA、AB和AC,其基因型频率分别为0.6082、0.268、0.1237,AA为优势基因型;A、B和c基因的基因频率分别为0.8041、0.1340和0.0619。引物P5扩增片段在LS中只检测到2种基因型,分别为GG和FF,其基因型频率分别为0.9和0.1,GG为优势基因型;G和F基因的基因频率分别为0.9和0.1。群体遗传特性分析结果表明,P2引物扩增片段在LS、JBG和JDG群体中处于低度多态(PIC分别为0.1645,0.2433,0.2442),而在ZS、CMG和NBG群体中处于中度多态(PIC分别为0.3192,0.3671,0.347);LS的P4引物扩增片段处于中度多态(PIC为0.303),P5引物扩增片段处于低度多态(PIC为0.164)。所研究羊群体都具有相对较高的遗传杂合度,说明这些羊还具有一定的选择潜力。凉山半细毛羊体重性状表型资料的相关分析表明,初生重和1.5岁体重(r=0.5408.P<0.01)断奶重和断奶日增重(r=0.9784,P<0.01)之间有极显著的正相关。方差分析结果:P2引物扩增片段基因型效应对初生重(P<0.05)和1.5岁体重(P<0.01)分别有显著和极显著的影响;P4引物扩增片断的家系效应对初生重(P<0.05)和1.5岁体重(P<0.01)分别有显著和极显著的影响;3对有多态性引物的年度效应均对初生重(P<0.01)、1.5岁体重(P<0.01)和2.5岁体重(P<0.01)有极显著的影响。P2引物扩增片段不同基因型与初生重和1.5岁体重的最小二乘差异比较发现,DE基因型对初生重的影响显著高于DD基因型(P<0.05),DE基因型对1.5岁体重性状的影响极显著高于DD基因型和EE基因型(P<0.01)。
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