随着农业产业结构的调整,设施蔬菜已逐渐形成规模化和专业化生产,由于耕地面积的限制和经济利益的驱使,设施内蔬菜种植出现连续复种,指数在不断提高,种植品种比较单一,随之而来的设施蔬菜连作障碍的产生,连作常导致蔬菜作物产生病虫害,植株提早老化,产量也降低,品质也显现降低趋势。西瓜是设施园艺的主栽种类之一,连作障碍问题严重制约着西瓜产业的可持续发展。目前,为了解决西瓜连作障碍,尤其是西瓜连作导致的西瓜枯萎病害,人们不断对其产生机理进行探索研究,这一问题已被列为当代农业生产中急需解决的课题。有研究表明麦类作物与瓜类作物伴生,或利用小麦残茬能够有效的缓解瓜类连作障碍。本试验研究了两种小麦残茬对连作西瓜形态学指标、生理指标以及根尖内部超显微结构的影响,应用稀释平板法来测定本试验中处理植株根际土壤微生物数量的变化,并通过Real-time PCR对西瓜根际土壤中功能微生物芽孢杆菌和西瓜专化型尖孢镰刀菌的数量进行分析。结果表明：1、D123和D125处理对西瓜植株的株高、茎粗和鲜重均有一定的促进作用,但D125处理在定植第40d时西瓜植株株高显著高于对照；在定植第30d、40d时D125处理的鲜重显著高于对照。在西瓜定植第20d时,处理植株的根系活力低于对照,其中D125处理与对照差异显著；在定植30d时,两个处理组植株的根系活力高于对照,但差异基本不显著。从试验植株根尖的超显微结构可以看出,D125处理细胞生命特征强于对照和D123处理,且D125处理的西瓜植株根系总长度和总体积显著高于对照。2、不同品种小麦残茬处理后的西瓜植株发病情况不同,D123处理的发病率和病情指数高于D125处理和对照,而D125处理的西瓜枯萎病发病率和病情指数表现出均低于对照。3、施入小麦残茬后,随着西瓜植株的生长,土壤pH呈增加趋势；D125处理土壤的EC值随着植株生长呈现上升趋势,D123处理土壤的EC值变化趋势与D125相反。4、随着西瓜植株的生长,两个处理和对照根际土壤中真菌、细菌和尖孢镰刀菌的数量呈现上升趋势,且各时期处理的测定值均也高于对照,定植30d时处理和对照间差异已经达到显著水平。5、随着西瓜植株不断的生长,处理组根际土壤中芽孢杆菌的数量均高于对照,在定植30d时达到显著差异;随着植株的生长,处理和对照根际土壤中西瓜专化型尖孢镰刀菌的数量均呈现增长趋势,但各时期处理的病原菌的数量均低于对照,且在定值后第40d时达到显著差异。