Ⅰ型整合子介导的虾源大肠杆菌耐药传播机制研究

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南美白对虾是全球产业链发展最为成熟的集约化高产养殖水产品种之一。抗生素在促进其产量增长的同时,也带来了严重隐患,耐药菌及其耐药基因不仅能够在水产养殖环境中持续残留,也可以在水产品供应链中传播扩散,并通过食物链传递给人类,对公众健康造成严重危害。其中,Ⅰ型整合子因能捕获、整合、切除和表达耐药基因,在耐药传播中发挥重要作用。大肠杆菌作为耐药基因传播的重要媒介和潜在来源库,也扮演着重要角色。因此,本研究分别采集养殖场、农贸市场和超市等不同来源的南美白对虾样品,从样品中筛选大肠杆菌,制作其耐药谱,进而研究虾源大肠杆菌Ⅰ型整合子的分布特征和Ⅰ型整合子-基因盒阳性大肠杆菌分离株间的亲缘关系,阐明Ⅰ型整合子介导的虾源大肠杆菌耐药传播机制。主要研究内容和结果如下:从400份养殖场、农贸市场和超市来源南美白对虾样品中总计分离到307株大肠杆菌,分离率依次为87.6%、69.0%和59.9%。养殖场来源南美白对虾样品大肠杆菌分离率显著高于农贸市场和超市来源样品(p<0.05);制作了大肠杆菌对8大类18种抗生素(抗菌药)的耐药谱,多重耐药率为32.2%,其中不同来源大肠杆菌普遍对四环素类抗生素、磺胺类药物和β-内酰胺类的先锋霉素、阿莫西林和氨苄青霉素等耐药率较高,对亚南培南和多粘菌素的耐药率最低。分别从养殖场、农贸市场和超市南美白对虾样品中分离得到40株、43株和32株Ⅰ型整合子阳性大肠杆菌,其中依次有6株、4株和6株携带有Ⅰ型整合子-基因盒。测序结果显示,87.5%(14/16)的Ⅰ型整合子-基因盒携带耐药基因,且与氨基糖苷类、甲氧苄胺嘧啶类和磺胺类等抗生素耐药传播相关,其中dfrA1-aadA1为其主要的基因盒阵列。此外,大肠杆菌的多重耐药性与其携带Ⅰ型整合子存在极显著正相关(p<0.01)。16株Ⅰ型整合子-基因盒阳性的虾源大肠杆菌分为10个PFGE脉冲型和ST型,分型结果表明其整体亲缘性较远,虽存在少量的垂直传播,但可能主要以Ⅰ型整合子介导的水平基因转移的方式进行水平传播。对16株虾源大肠杆菌的Ⅰ型整合子-基因盒进行Southern杂交定位,结果显示,12株大肠杆菌的Ⅰ型整合子-基因盒位于质粒上,其余4株位于基因组上。12株大肠杆菌其携带Ⅰ型整合子-基因盒的质粒均可通过接合转移和转化获得接合子和转化子;质粒复制子分型结果显示,12株质粒均为IncF型质粒。采用PCR步移法对Ⅰ型整合子-基因盒侧翼序列进行分析,发现质粒和基因组上的虾源大肠杆菌Ⅰ型整合子-基因盒可通过插入序列(IS6、IS26)和转座子元件(Tn3、Tn3-like)等可移动遗传元件介导进行水平传播。
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