院系作为构成高校的核心单位，是承担高校基本职能的重要载体。当前，我国高校院系设置存在学科综合化程度不高，院系数量极度膨胀，管理权力分配不均等问题。因而，探究1949年前我国高校院系设置情况及其发展变迁特点，可以揭示我国高校院系设置的早期样态，并且有助于指导当前高校院系的科学设置。　　本研究以北京大学、天津大学、南京大学和武汉大学四所百年老校为案例，将四所高校1949年前的院系设置演变过程分为四个阶段，即1895年至1912年民国政府成立为第一阶段，1912年至1919年五四运动爆发为第二阶段，1919年至1929年《大学组织法》颁布为第三阶段，1929年至1949年新中国成立为第四阶段。通过考察案例大学在不同阶段所设置院系的名称、结构、数量以及权力分配可以发现：1895—1949年我国高校院系设置经历了从“科-门”、“科-系”，再到“院-系”的结构变迁历程；学院（科）组织以学科门类为基准设立，数量少，结构稳定，而学系（门）设置受外部因素影响较大，变动较为频繁，数量越来越多；大学初创时期的院系名称、学科专业覆盖范围及其管理方式所体现的封建色彩、集权特征逐渐消退，最终形成类似于美国高校的院系设置与管理体制。概括而言，1949年前我国高校院系设置的演变过程有以下鲜明特点。第一，高校院系设置的演变与我国近代社会政治、经济、文化的变革和发展密切相关。第二，高校院系设置既不是我国传统教育机构的自然演化，也不是全盘学习西方的产物；第三，高校院系设置的演变是一个渐进发展的过程。