我国有着丰富的盐湖资源，西部和北部分布着近千个盐湖，其中792个盐湖分布于西藏、青海、内蒙古和新疆四省区。为了更好地认识新疆盐湖的嗜盐古菌多样性，从艾比湖和艾丁湖采集样品，分离嗜盐古菌，研究两盐湖可培养嗜盐古菌多样性与16S rRNA基因多态性。　　 用完全培养基(complete medium，CM)从艾比湖和艾丁湖样品中共分离获得112株嗜盐古菌，其中56株分离自艾比湖而另外56株分离自艾丁湖。测定了全部菌株16S rRNA基因的上游序列，基于16S rRNA基因的系统发育分析表明，分离自艾比湖的菌株属于Haloarcula、Halobacterium、Halorubrum、Haloterrigena、Natrinema和Natronorubrum共6个属的12个分类单元*；而艾丁湖则蕴藏了Natronorubrum、Natrinema、Haloterrigena、Halorubrum、Natrialba、Halobiforma和Haloarcula共7个属的11个分类单元。其中，Halorubrum、Haloterrigena、Natrinema和Natronorubrum属的菌株属于艾比湖和艾丁湖的优势属。16S rRNA基因序列相似性分析表明，菌株7-3及其它24株嗜盐古菌可能代表了Natronorubrum属一个中性的新的分类单元；AD2可能是Natronorubrum属一个嗜盐碱的新的分类单元；菌株9－3、ABH9和31－hong可能是Halorubrum属的两个新的分类单元；菌株ABH32、ABH33、ABH37、ABH40和AX－1可能代表了Halorubrum属两个新的分类单元；菌株BD－3是Haloarcula属一个新的分类单元；BD－4是Halobacterium属一个新的分类单元。艾比湖的嗜盐古菌生物多样性指数要略高于艾丁湖，造成这一现象的可能原因在于两盐湖的卤水特性的差异、气候的不同以及人类活动对盐湖水源的影响。　　 对菌株BD－3、9-3、31－hong、ABH32、AX－7、7-3和AD2共7株嗜盐古菌的形态特征、生理及生化特性、极性脂组成、16S rRNA基因序列和DNA－DNA同源性进行研究以阐明这些菌株的分类学地位。结果表明，这7个菌株应为新种，分别命名为：Haloarcula amylolytica BD－3T、Halorubrum lipolyticum9—3T、Halorubrumaidingense31-hongT、Haloterrigena longa ABH32T、Haloterrigena limicola AX－7T、Natronorubrum aibiense7-3T和Natronorubrum sulfidifaciens AD2T。　　 在过去的几十年中，核糖体小亚基RNA一直是微生物鉴定和分类中的重要指标。然而，在一些物种的同一基因组中存在着序列差异较大的不同类型16S rRNA基因，这使得在进行物种分类与鉴定时，16S rRNA基因的可靠性备受关注。选择Haloarcula属的全部成员和相近属的Halomicrobium mukohataei JCM9738T为研究对象，研究其16S rRNA基因多态性。结果表明，所有Haloarcula的全部成员都拥有差异达5％的两个16S rRNA基因拷贝；而Halomicrobium mukohataei JCM9738T则拥有差异达9％的16s rRNA两个基因拷贝。逆转录PCR的结果表明，这些不同拷贝16S rRNA基因均能转录为16S rRNA。系统发育分析的结果表明，Haloarcula属的全部成员聚成一支，仍属于同一属的成员；而Halomicrobiummukohataei JCM9738T的两个16S rRNA基因拷贝也聚成一支。上述结果表明16SrRNA基因在嗜盐古菌属级水平的分类鉴定中具有很高的可靠性。　　 本论文主要研究新疆地区两个盐湖可培养嗜盐古菌多样性，描述新的嗜盐古菌类群，丰富了嗜盐古菌物种多样性，为进一步的理论与应用研究提供菌种资源。对Haloarcula属和Halomicrobium属的全部物种16S rRNA基因多态性进行的研究，可以为16S rRNA基因在嗜盐古菌分类与鉴定中的进一步应用奠定初步的基础。