SSR技术在黄瓜遗传多样性及杂种纯度鉴定上的应用

来源 :中国农业科学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:C_Adrian
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黄瓜是一种重要的蔬菜作物,品种资源较为丰富。开展黄瓜种质资源遗传多样性的研究,有利于黄瓜种质资源的收集、保存、鉴定、创新和有效利用。本研究综合采用形态和SSR标记对59份来源和类型不同的黄瓜种质进行了系统分类学研究。对黄瓜种质59个形态性状进行鉴定和分析的结果表明,其平均变异系数和平均形态多样性指数分别为0.59和1.26。基于形态数据的聚类分析,59份种质被分为7大类群,即美国加工型类群、混合型类群、欧洲温室型类群、版纳黄瓜、D28、华南型类群和华北型类群。聚类结果比较好地反映了黄瓜种质间的形态相似性及其与地理区域之间的关系。利用62对SSR引物在59份黄瓜种质中共扩增出了213条带,其中多态性带数为170条,多态性比率为79.8%。平均每对引物扩增出3.74条带和2.74条多态性带。62对引物由基因组SSR和EST-SSR两部分组成,其中属中、高度多态性位点的引物占了66%,说明所选的引物具较高的多态性。本研究首次使用EST-SSR研究黄瓜的遗传多样性,结果显示,根据EST上合成的引物,平均标记多态信息含量PIC(0.38)和平均引物多态条带数(3.21)均明显大于根据基因组合成的引物(分别是:0.29和2.60),表明EST-SSR标记比传统SSR标记有更好的多态效率。所选SSR引物中有些引物可以在某些黄瓜材料中扩增出特异条带。供试的七种生态型材料中,除日本类型外,都扩增出特异条带,其中材料D59扩增出的特异条带最多,共扩增出3条特异性条带。基于SSR标记的遗传距离矩阵对59份黄瓜种质进行聚类分析,供试材料间遗传距离范围为0.04~0.54,平均遗传距离为0.26。供试材料被分为7个类群:美国型类群、欧洲温室型类群、版纳类型、D28、D38、欧洲和华北的混合型类群、华北类群。形态学与SSR标记分类结果基本一致,两者都基本能按区域分布把供试材料分开,但根据SSR结果分类更为可靠。种子是农业生产的基础,其纯度是种子质量标准的首要指标,杂种纯度鉴定可以有效检测种子质量,为作物的增产、稳产提供保证。生产上一般根据表型性状鉴定黄瓜种子纯度,费时、费工、周期长。本研究从271对SSR引物中分别筛选出带纹清晰且双亲条带差异明显的引物CS24、CS06、CSWTA16分别用于中农8号、中农10号、中农16号杂交种的纯度鉴定。SSR鉴定出的杂株与形态学确定的杂株能达到单株一致。SSR标记比形态学鉴定操作简单、省时省力,因而比形态学鉴定更适用于黄瓜的杂种纯度鉴定。
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