通过深度强化学习进行分子药物设计

来源 :大连理工大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:starcui123
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
深度强化学习是一种兼具深度学习的感知能力以及强化学习的决策能力的人工智能技术,具有广泛的应用前景。在医药研究方面,深度强化学习在新药发现上的应用亟需进一步研究发展。核输出蛋白CRM1负责多种肿瘤抑制因子、细胞周期相关蛋白的核质运输。在多种肿瘤细胞中,CRM1过表达导致肿瘤抑制因子及周期蛋白的错误定位,无法正确发挥其特定的功能和作用。通过干扰CRM1介导的运输机制能够有效缓解与细胞增殖、蛋白的错误定位相关的各种人类疾病的发生与发展。近年来,CRM1作为肿瘤潜在的治疗靶点吸引了极大的关注。结外NK/T细胞淋巴瘤(ENKTL)是一种恶性程度高且预后效果很差的非霍奇金淋巴瘤的一种亚型,目前还没有有效的治疗方式。肿瘤的靶向治疗具有高效性以及安全性的特征。因此。针对结外NK/T细胞淋巴瘤靶向治疗研究是一种很有前景的研究方向。本研究,利用基于深度强化学习技术,在现有的CRM1抑制剂莱菔素的结构基础上,进行结构优化改造。设计靶向性更强的、成药性更好的CRM1小分子抑制剂,为结外NK/T细胞淋巴瘤提供新的治疗方案。本次研究主要得出以下结论:(1)利用深度强化学习,设计得到了CRM1靶向小分子抑制剂LFS-1107,通过分子对接、分子动力学模拟等手段检测了LFS-1107与CRM1蛋白之间的相互作用,解释了LFS-1107对CRM1蛋白的作用靶点为位于其疏水活性口袋的半胱氨酸残基。并对比了LFS-1107和莱菔素在与CRM1互作中,结合强度的大小以及发挥疏水相互作用的主要氨基酸残基的差异。(2)通过细胞活性测试,证实了LFS-1107对结外NK/T细胞淋巴瘤的选择性杀伤,而对正常的外周血单核淋巴细胞(PBMC)以及血小板活性基本没有影响。通过免疫荧光实验发现,LFS-1107能够通过靶向CRM1,抑制IκB-α的细胞核输出。蛋白印迹实验以及Elisa说明LFS-1107能够下调NF-κB信号通路。结合转录组的实验结果发现,LFS-1107能够上调凋亡通路,促使ENKTL细胞发生凋亡。本研究通过深度强化学习的方法设计得到了活性更强的CRM1小分子抑制剂LFS-1107,检测了LFS-1107对结外NK/T细胞淋巴瘤增殖活性的抑制作用,并对其中的作用机制进行了初步探究。
其他文献
从20世纪90年代起,随着经济全球化进程的不断深入,种族文化间的界限被削弱,国家间的依存关系日益紧密,人才和劳动力的流动也随之出现。伴随着大批外籍打工者、留学生、跨国婚
目的:在军校学员群体中初步修订创伤后成长量表,进行条目分析、探索并验证其因子结构。方法:将创伤后成长量表翻译成中文,施测于706名近几年经历各种创伤事件的军校学员。将
本文概述了近50年来蛋白质凝胶电泳仪器和技术的发展及趋向。
<正>目的通过对各种肿瘤患者血清中抗SPAG9自身抗体的检测,初步了解肿瘤患者外周血中抗SPAG9自身抗体的表达情况,从而了解SPAG9所引起的体液免疫反应。方法以2009年7月至2010
会议
据《南国今报》等媒体报道,3月17日,在柳州开往南宁东的动车上,乘客陈医生听到车内广播紧急呼叫,同程旅客出现腹痛情况,遂紧急赶往事发现场对其进行救助。但随后发生的事情,让陈医
报纸
只要继续推进改革、优化营商环境,通过扩大内需与产业升级双轮驱动,中国在全球供应链、产业链的位置会进一步巩固。$$新年以来,新冠肺炎疫情爆发导致一部分国内企业相当长时间的
报纸
鉴于从多层公寓式建筑主动疏散效率低下,提出人员通知的被动疏散动员理念,并开发疏散通知方案的优选方法。以某校西-9宿舍楼为例,将建筑简化为拓扑结构,设计通知方案,并与一
电力变压器作为电网主要枢纽设备,在电力系统中具有举足重轻的地位,其运行状态直接影响电网的安全运行。及时、准确地判断变压器故障类型一直是学者们研究的热点,传统的三比值法是过去几十年来应用最为广泛的故障诊断方法,但因其编码存在边界、模糊等缺陷致使故障诊断的正确率不高。同时随着各种在线检测装置的应用,电力设备检测数据爆炸式增长,传统诊断方法更显得心余力绌;而数据挖掘技术在处理海量数据、挖掘隐藏信息方面具
哈耶克是20世纪西方著名的政治学家和经济学家,当代新自由主义思潮的代表人物。他毕生视自由为永恒之理想,一贯坚持古典自由主义观点,将自由界定为"独立于别人的专断意志之外"
<正>合理化建议活动既是一种有效的管理手段,也是一种良好的文化策略,它为管理者与职工、职工与职工之间架设了一座沟通的桥梁,对企业的振兴和发展具有推动作用。合理化建议