论文部分内容阅读
目的: 近亲婚配的家系易患遗传性视网膜疾病,通常是由于致病的隐性基因双等位突变引起。本研究旨在通过应用目标区域捕获测序技术方法探究3个患有遗传性视网膜疾病的中国近亲家系的遗传易感性以及基因型和表型的相关性,揭露相关的致病基因和突变,。 方法: 我们收集了3个无关联的患有遗传性视网膜疾病的近亲家系,包括3名先证者和12个正常的家族成员。我们对研究对象进行了详尽的眼科临床检查,采集相关的临床资料,然后利用目标区域捕获测序技术对这3个近亲家系的先证者进行致病基因的筛查,通过过滤筛选出候选的基因突变。对候选的基因突变采用生物信息学的方法分析致病性和对蛋白结构的影响,包括基因突变的致病性预测、蛋白氨基酸序列的保守性分析、突变蛋白的3D结构模型建立等。最后我们利用Sanger测序法结合家系共分离验证这3个近亲家系筛选出的致病基因和突变。 结果: 本研究报道了3个患有异质性的遗传性视网膜疾病的中国近亲家系纯合的致病基因突变,包括一个新突变和两个已知突变。第1个家系中的先证者患有典型的视网膜色素变性,携带首次发现的纯合的移码突变FAM161A (c.1654_1655del, p.R552Afs*5),导致编码的FAM161A蛋白的氨基酸序列改变并提早终止蛋白的合成, 影响了位于视网膜光感受细胞中纤毛连结部位的纤毛基体复合物的物质运输功能。第2个家系中的先证者患有视网膜色素变性伴随罕见的黄斑和脉络膜缺损,携带已报道的纯合的错义突变RDH12(c.437T>A, p.V146D),有着复杂的基因型与表型关联。RDH12蛋白参与视网膜光感受细胞中全反式视黄醇和11-顺式视黄醇转换成视黄醇的生理过程。通过对不同物种RDH12蛋白氨基酸序列的多重比对,显示了V146D错义突变影响了在进化上蛋白高度保守的氨基酸区域。RDH12蛋白的3D结构模型直观地显示了突变V146D所在的蛋白空间结构中的改变,突变后的天门冬氨酸分别与第124位氨基酸天冬酰胺和第149位氨基酸亮氨酸之间产生了新的结合,同时与第150位氨基酸甘氨酸之间的氢键连结断裂。第3个家系中的先证者患有视锥视杆细胞营养不良,携带已报道的纯合的错义突变CRB1 (c.3991C>T, p.R1331C),编码的CRB1蛋白影响了视网膜组织中Mullar细胞和光感受期细胞间的粘附功能。通过对不同物种CRB1蛋白氨基酸序列的多重比对,显示了R1331C错义突变影响了在进化上蛋白高度保守的氨基酸区域。 结论: 本研究采用目标区域捕获测序技术成功对患有遗传性视网膜疾病的3个近亲家系进行了分子诊断,首次报道了视网膜色素变性全新的纯合致病突变FAM161A (c.1654_1655del, p.R552Afs*5),丰富了遗传性视网膜疾病的基因突变谱和基因型-表型关联。此外本研究证明了目标区域捕获测序技术对患有异质性的遗传性视网膜疾病的近亲家系提供了一种临床上行之有效的遗传诊断方法和策略。