本研究以新疆4个集约化种猪场为试验基地，通过菌落计数法对空圈舍最佳消毒方式进行选择和4种消毒液配置后的有效时限进行确定。结果表明，猪场空圈舍经清水冲洗，2%氢氧化钠的喷洒，2小时后再经清水冲洗，空三天，固体甲醛熏蒸消毒是最佳消毒方式；消毒液的有效时限均为配制后48h之内。本研究采用酶联免疫吸附试验筛选不同生长阶段猪群猪瘟活疫苗、高致病性蓝耳病（即高致病性猪繁殖与呼吸综合症）活疫苗和口蹄疫灭活疫苗的最佳免疫程序。结果表明，最佳方式为：21日龄、50日龄分别颈部肌肉注射猪瘟活疫苗、高致病性蓝耳病活疫苗1ml，170天后加倍剂量加强免疫一次；40日龄颈部肌肉注射口蹄疫灭活疫苗1ml，后每3个月加倍剂量加强免疫一次；基础母猪跟胎免疫。对病死猪心、肝、脾等组织进行细菌分离培养，应用细菌形态学观察、聚合酶链式反应对病原菌进行鉴定，通过药敏试验研究其耐药性，并对猪群进了预防保健性投药。结果表明，从病死猪中分离出链球菌、副猪嗜血杆菌、巴氏杆菌和传染性胸膜肺炎4种主要致病菌，其对头孢噻呋钠和氟苯尼考敏感，且该药预防保健效果良好。集约化种猪场生物安全体系主要包括猪场消毒、猪群保健和疫苗免疫三个大方面，本研究通过对以上三个大方面的研究，初步建立了集约化种猪场的生物安全体系，为猪群的稳定、健康发展提供了理论依据。