继电保护及故障信息处理系统旨在实现对电力系统二次装置的设备管理、运行状态监视、动作定值整定、以及对二次装置所记录的电网异常或故障信息的综合有效运用分析等。国家电网公司已在一系列文件中对上述系统的建立、实施及考核提出了明确的要求。本论文根据多年继电保护故障信息处理子站系统的运行经验,试图设计一种新型继电保护故障信息处理子站系统以适应数字化变电站的需求。该系统主要包括硬件系统和软件系统两大部分。论文首先对继电保护故障信息处理子站系统进行总体设计,设计了嵌入式继电保护故障信息处理子站系统以期满足大多数需求；其次阐述了以EP9312微处理为核心的开发平台的硬件设计及实现过程；再以此硬件平台为基础,论述了嵌入式Linux操作系统的移植过程,嵌入式子站系统的软件体系结构；最后结合嵌入式子站系统现场实际应用的需求,设计了嵌入式子站系统的测试模型,并进行了基本功能和性能测试、电磁兼容性能测试等,给出了现场应用总结。本论文所设计的嵌入式子站系统不同于以往的子站系统,而是将嵌入式技术与以太网通信技术相结合,因此在总体方案和设计思想上均具有新意。