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目的：基底细胞型乳腺癌和HER2过表达型乳腺癌是乳腺癌分子分型中预后最差的两种亚型。临床中常用三阴性代替基底型乳腺癌做研究。本研究将比较三阴性乳腺癌和HER2过表达型乳腺癌预后,以及拓扑异构酶Ⅱ(TopoisomeraseⅡ, TopoⅡα), P53蛋白在两种亚型中的表达及其与预后的关系,从而为临床判断预后及合理用药提供更充分的理论依据。方法：本研究选取2004年1月至7月间于天津医科大学附属肿瘤医院手术的乳腺癌患者546例为研究对象。通过免疫组化的方法检测ER, PR, HER2蛋白表达,根据三者的表达,选取三阴性乳腺癌101例和HER2过表达型乳腺癌101例,比较两型乳腺癌的临床病理特征和预后。运用免疫组化方法进一步检测TopoⅡa,P53蛋白在两型乳腺癌中的表达,及其与预后的关系。结果：1.与三阴性乳腺癌相比,HER2过表达型乳腺癌有着较高的淋巴结转移率,且肿瘤直径大于2cm的比例较高,二组差异均具有统计学意义(P=0.039,P=0.045)。三阴性乳腺癌和HER2过表达型乳腺癌患者5年无病生存率分别为61.4%和73.3%,二者差异有统计学意义(p=0.039)。5年总生存率二者分别为78.2%和86.1%,二者差异无统计学意义(p>0.05)。2.TopoⅡα蛋白在三阴性乳腺癌中的表达率为65.3%,在HER2过表达型乳腺癌中的表达率为62.4%,二者差异无统计学意义(p/>0.05)。TopoⅡα蛋白表达水平与两型乳腺癌患者年龄、肿瘤大小、临床分期、腋下淋巴结转移状况、组织学分级、病理学类型等临床病理指标均无相关性(P>0.05)。3.HER2过表达型乳腺癌中, TopoⅡα蛋白阳性和阴性组5年无病生存率为81.0%和60.5%,5年总生存率分别为92.1%和76.3%,两组差异均具有统计学意义(p=0.037,P=0.047)。多因素分析结果显示TopoⅡα蛋白表达可以作为HER2过表达型乳腺癌的独立预后因子。4.三阴性乳腺癌中,TopoⅡα蛋白阳性和阴性组5年无病生存率分别为69.7%和82.4%,差异具有统计学意义(p=0.044),5年总生存率分别为75.0%和84.5%,二者差异无统计学意义(P=0.927)。5.P53在三阴性乳腺癌中的表达率为40.9%,在HER2过表达型乳腺癌中的表达率为39.5%,二者差异无统计学意义(p>0.05).6.三阴性乳腺癌中,P53蛋白阳性和阴性组5年无病生存率分别为61.1%和84.6%,差异具有统计学意义(p=0.023),5年总生存差异无统计学意义(p＞O.05)。HER2过表达型患者中,P53蛋白表达与无病生存和总生存率方面的差异均无关。7.三阴性乳腺癌患者中,TopoⅡα和P53双阳性患者的无病生存率为43.5%,明显低于TopoⅡα或P53单阳性组79.2%和TopoⅡα, P53双阴性组82.6%,差异有统计学意义(p=0.046)。结论：1.在中国女性乳腺癌分子分型中,三阴性乳腺癌较HER2过表达型乳腺癌预后更差,提示对于此类患者应该密切加强随访。2.在HER2过表达型乳腺癌组,TopoⅡα蛋白阳性的患者预后较好,提示此型乳腺癌患者可从蒽环类化疗药物中获益,为临床用药提供一定的理论依据。3.在三阴性乳腺癌患者中,P53和TopoⅡα蛋白共表达患者较P53/或TopoⅡα蛋白阳性预后更差,对于临床判断预后具有指导意义。