SNHG4/miR-204-5p在胃癌发生发展中的作用及相关机制研究

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目的:胃癌是全球最具侵袭性的恶性肿瘤之一,尽管早期诊断和治疗有助于显著提高该疾病的五年生存率,然而大多数患者在早期无明显症状,胃癌的诊断经常发生在晚期。因此,对早期胃癌的可用筛选方法的研究对于预防和治疗胃癌仍然至关重要。长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lnc RNA)是长度大于200个核苷酸的非编码RNA,尽管没有蛋白编码功能,但可以在肿瘤细胞增殖、侵袭、凋亡等多个生物学过程中发挥重要作用。lnc RNA已经被证明可以参与胃癌的发生发展。长链非编码小核仁RNA宿主基因家族(Long non‐coding small nucleolar RNA host genes,SNHGs)为lnc RNA的一类,多数研究表明SNHGs成员的表达水平与胃癌患者的预后及临床病理特征关系密切,但相关研究所得结果间差异较大,因此本文首先通过荟萃分析,系统评价SNHGs在胃癌组织中的表达水平与胃癌患者的预后及临床病理特征的关系。小核仁RNA宿主基因4(Small nucleolar host gene 4,SNHG4)是一个全长为1100 bp的lnc RNA,属于SNHGs,在多种肿瘤中起到至关重要的作用。结合国内外多种文献数据库检索,发现尚无SNHG4与胃癌的相关研究及报道。研究表明SNHG4与miR-204-5p在肿瘤中可能具有靶向关系。miR-204-5p作为微小RNA(Micro RNA,miRNA)的一种,已被确定在胃癌中表达下调,被认为是一种肿瘤抑制因子,参与胃癌的发生发展。因此,接下来我们的研究重点探讨SNHG4/miR-204-5p在胃癌发生发展中的作用及其机制。方法:第一部分:利用Pubmed、Web of science等国内外文献数据库检索各种SNHGs成员在胃癌组织中的表达和胃癌患者预后及临床病理特征之间关系的研究,根据纳入及排除标准进行文章筛选后,提取生存期、无病生存期及各项临床病理特征的详细数据,应用Rev Man 5.3软件进行数据荟萃分析,计算合并的风险比、比值比和95%可信区间,评估SNHGs在胃癌组织中的表达与胃癌患者预后及临床病理特征之间关系。第二部分:利用生物信息学方法,通过多种在线数据库对SNHG4在胃癌中的表达水平及与患者预后关系进行分析,预测SNHG4-miRNA-m RNA调控网络,进一步对靶基因进行生物学功能预测。结合预测结果我们发现胃癌中SNHG4和miR-204-5p之间存在潜在的相互作用关系,为此我们着手进一步研究。应用实时荧光定量PCR技术,检测SNHG4在正常胃上皮细胞和胃癌细胞系中的表达情况;利用基因敲低和细胞转染技术,构建SNHG4低表达的胃癌细胞系,通过CCK-8检测、流式细胞仪术、细胞划痕实验及Transwell等实验来验证SNHG4在胃癌细胞增殖、迁移和侵袭等过程中的作用;双荧光素酶报告法验证SNHG4与miR-204-5p的靶向性;再次利用细胞转染技术,转染NC inhibitor或miR-204-5p inhibitor于敲低SNHG4的胃癌细胞中,进行增殖、侵袭相关实验;最后,建立裸鼠胃癌移植肿瘤模型,获得肿瘤标本后,通过实时荧光定量PCR、蛋白印迹、免疫组化等实验进一步验证SNHG4/miR-204-5p在胃癌发生发展中的作用及相关机制。结果:第一部分:根据不同SNHGs在胃癌中的表达程度不同,以及发挥致癌和抑癌的作用效果不同,我们将SNHGs分为致癌基因及抑癌基因两个组别进行研究。荟萃分析结果为致癌基因组高表达与胃癌患者较短的生存期及较短的无病生存期相关,与胃癌较晚的TNM肿瘤分期,容易发生淋巴结转移和远处转移密切相关;抑癌基因组低表达与胃癌患者较短的生存期和较短的无病生存期相关,与较大的肿瘤直径、较晚的TNM肿瘤分期和深度肿瘤浸润密切相关。对上述结果进一步整合,无论致癌基因组还是抑癌基因组,SNHGs的表达与胃癌患者的总体生存期和无病生存期相关,同时与胃癌的TNM肿瘤分期密切相关。第二部分:通过生物信息学分析,我们发现SNHG4在胃癌组织中的表达明显高于正常组织;生存分析发现SNHG4高表达的胃癌患者总体生存时间少于低表达组;通过RNA调控网络的构建,发现在胃癌中hsa-let-7a-5p、hsa-miR-152-3p、hsa-miR-204-5p和hsa-miR-363-3p可作为SNHG4的结合位点;SNHG4作用于这4种miRNA进一步调控250个靶基因;对靶基因进行GO注释及KEGG富集分析,发现这些靶基因在蛋白质磷酸化的调节、转录负调控、RNA聚合酶II启动子的转录等生物过程中发挥作用,且通过阻断或激活多条信号通路参与胃癌的发生发展。通过进一步实验我们发现,与正常胃黏膜上皮细胞相比,胃癌细胞中SNHG4的表达水平较高,与生物信息学分析结果相一致;敲低SNHG4显著抑制胃癌细胞的增殖、迁移和侵袭,并阻断细胞周期进程;结合生物信息学分析结果与双荧光素酶报告基因检测结果,确定miR-204-5p是SNHG4的直接靶标;敲低SNHG4可上调miR-204-5p表达,下调miR-204-5p靶基因RRM2的表达;同时,抑制miR-204-5p的表达可促进sh SNHG4转染的胃癌细胞的增殖和转移,说明miR-204-5p表达的抑制可以逆转sh SNHG4对胃癌发生发展的抑制作用。此外,通过对裸鼠胃癌移植瘤模型进行检测,降低SNHG4的表达可以减缓裸鼠胃癌移植瘤的生长;降低SNHG4表达可促进miR-204-5p的表达,抑制RRM2的表达,并且抑制胃癌细胞增殖及转移。体内实验结果与体外细胞实验结果相同,证明敲低SNHG4的表达抑制裸鼠胃癌移植肿瘤模型中的肿瘤发展。结论:1.SNHGs的表达水平与胃癌患者的预后及临床病理特征相关。2.利用生物信息学分析证明SNHG4在胃癌组织中高表达,与胃癌患者临床病理特征及预后密切相关。细胞及动物实验进一步明确,胃癌细胞及组织中SNHG4的表达水平明显增高。3.SNHG4/miR-204-5p在胃癌的发生发展中起重要作用,SNHG4与miR-204-5p两者间具有靶向关系,通过降低SNHG4的表达可上调miR-204-5p的表达,达到抑制胃癌细胞的增殖、迁移及侵袭,抑制胃癌发生发展。
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