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地萼苔科(Geocalycaceae)是苔藓植物门(Bryophyta)苔纲(Hepaticae)叶苔目(Jungermanniales)中的一个大科,全世界现报道约有23属300余种,我国现记录有7属38种,广泛分布于南方和东北地区。地萼苔科植物种类众多,其因地域差异所造成的植物体在配子体和孢子体形态、种群分布、生态特征等方面的差异较为明显,且其多与其他苔藓共同形成群落,这就为野外的样本采集和物种鉴定带来了很多麻烦。长期以来,世界各国学者根据不同的形态学特征研究该科的系统发育得到的结果存在较大偏差,特别是属间和属内种间的系统位置存在许多争议。伴随着DNA测序技术的发展而兴起的分子系统学研究手段近年来越来越多的渗透到苔藓植物学各研究领域。然而时至今日,国内关于地萼苔科分子系同学方面的研究至今仍未见报道,世界范围内有关该科分子系统学研究的报道也相对较少,且大多集中于分类较为混乱的Lophocopeodieae亚科,其余则研究较为零散,至今仍无一个较为完善的关于该科的分子系统学研究分析。本研究以中国现搜集到的中国地萼苔科4属28种共计245份植物标本为材料,通过对ITS、rbcL、trnL-F和,iad5等4个基因片段进行了分子系统学分析,利用最大似然法(Maximum likelihood)和最大简约法(Maximum parsimony)的建树结果构建系统进化树,参考各物种的野外种群分布等生态特点,同时综合形态解剖学的研究成果,对各物种在进化发育上的相对亲缘关系做出分析,以期为经典苔藓植物形态分类学的观点提供新的分子证据,建立一个新的、科学、实用的中国地萼苔科演化体系。本研究的主要结论如下:]、支持将镰萼苔属(Harpanthus Nees)移出地萼苔科,但是否如高谦&吴玉环(2010)建议的列入扭萼苔科(Plectocoleaceae C. Cao, Y. H. Wu&W. Li),需后续增加分子实验数据支持;2、关于薄萼苔属(Leptoscyphus Mitt.)的系统位置是否应该列入齿萼苔科(Lophocoleaceae (Jorg.) V. Bergh.(1956) emend. C. Gao, Y. H. Wu&W. Li),目前存疑,后续研究应增加该属类种群样本数量,并在形态和分子两方面加强研究力度。3、支持高谦&吴玉环(2010)根据雌苞结构类型的不同将拟蒴囊苔属(Saccogvnidium Grolle)蒴囊苔属(Saccogyna Dumort.)和地囊苔属(Geocalyx Nees)三个属归于修正过的狭义地萼苔科(Geocalycaceae Klinggr. emend. C. Gao&Y. H. Wu).4、支持Srivastava等(2002)、He-Nygren等(2003)的将异萼苔属(Heteroscyphus Schiffn.)按照叶缘、腹叶和三角体等形态特征划分为两个亚属的建议;同时提议将该属Heteroscyphus argutus、H. zollingeri、H. tridentatus和H. planus四个种合并为广义上的一个大的种。5、建议将Chiloscyphus中在形态学方面非常相似且构树时常聚为一类的一些种,如Chiloscyphus polyanthus、C. latifolius、C. cuspidatus、C. minor和C.profundus等划分为Chiloscyphus的一个亚属;该属其余种类的分类修订存疑。