新疆汉族人群结核分枝杆菌免疫优势Th表位的筛选与鉴定

来源 :石河子大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:suqingcsj
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:筛选与鉴定新疆汉族人群结核分枝杆菌免疫优势Th表位,并初步评估其免疫原性及免疫保护效果,继而为设计重组卡介苗菌株、研发以表位为基础的新型结核病疫苗及结核病特异性诊断试剂提供基础依据。方法:1.生物信息学软件预测。采用NCBI网站获取结核分枝杆菌抗原蛋白Rv3874,Rv0934,Rv3875,Rv3804c,Rv3878的氨基酸序列,用EXPASY软件分析其与人类蛋白质组的同源性。应用DNAStar、SYFPEITHI、RANKPEP、Net MHCⅡpan四种生物信息学软件进行联合预测新疆汉族人群结核分枝杆菌Th表位,确定本研究的预测Th表位肽。2.SWISS-MODEL软件对Rv3874,Rv0934,Rv3875,Rv3804c,Rv3878进行三级结构同源性建模。采用Py MOL软件对预测Th表位肽进行三级结构定位分析。3.采用Fmoc法合成预测Th表位肽。高效液相色谱(HPLC)对预测表位肽进行纯度分析,质谱(MS)对预测表位肽进行分子质量测定。4.CCK8法检测PBS组及40.0μg/m L、20.0μg/m L、10.0μg/m L、5.0μg/m L和2.5μg/m L五种不同浓度多肽组对淋巴细胞增殖水平的影响。探讨Th表位多肽刺激淋巴细胞的最佳工作浓度。5.采用CCK8法测定预测Th表位肽分别刺激外周血单个核细胞(PBMC)及CD4+T细胞的增殖情况,初步筛选出候选Th细胞表位肽。6.采用Brd U法测定候选Th细胞表位肽刺激CD4+T细胞增殖情况。7.候选Th细胞表位肽刺激PBMC后,流式细胞术进行CD4+T细胞增殖的表型分析。8.候选Th细胞表位肽刺激CD4+T细胞后,培养72 h,收集上清液,酶联免疫吸附测定(ELISA)方法检测细胞因子(IFN-γ,TNF-α,IL-2和IL-10)的水平。9.将候选Th细胞表位多肽包被酶标板,棋盘滴定法确定候选Th细胞表位肽作为包被抗原检测血清Ig G抗体最佳条件;间接ELISA法评价候选Th细胞表位多肽检测结核病的效能,筛选出具有诊断潜力的Th细胞表位多肽。结果:1.经生物信息学获得五条新疆汉族人群结核分枝杆菌预测Th表位肽,分别命名P39(Rv3874),P50(Rv0934),P40(Rv3875),P185(Rv3804c),P62(Rv3878)。2.利用SWISS-MODEL软件,得到五种抗原蛋白三级预测模型,其结果可靠,质量较好。使用Py MOL软件,结果显示P39、P50、P40、P185、P62均位于蛋白抗原结构的外部β片层和内部Loop区。3.P39、P50、P40、P185、P62的纯度分别为91.79%、96.27%、96.54%、92.61%、96.99%;分子质量测定值分别为1557.06、1575.30、1486.70、1410.80、1491.13。4.CCK8法确定Th细胞表位肽刺激淋巴细胞的最佳工作浓度为40μg/ml。5.CCK8法的初步筛选结果显示P39与P62能够刺激新疆汉族结核病患者的CD4+T细胞增殖,为候选Th细胞表位肽。6.Brd U法测定P39、P62及混合肽P39+P62刺激新疆汉族结核病患者的CD4+T细胞增殖活化情况,结果显示PBS组与P39组、P62组及混合肽P39+P62组比较差异均具有显著性(P<0.001)。7.流式细胞术进行P39、P62及混合肽P39+P62刺激PBMC后CD4+T细胞增殖的表型分析。结果显示P39、P62及混合肽P39+P62组与PBS对照组比较差异具有显著性(P<0.001)。8.ELISA结果显示P39、P62及混合肽P39+P62组CD4+T细胞上清中的IFN-γ、TNF-α、IL-2水平高于PBS组(P<0.001),混合肽P39+P62组的IL-10水平低于PBS组(P<0.001)。9.P39、P62及混合肽P39+P62的最佳包被浓度分别为10μg/ml、0.25μg/ml、10μg/ml。一抗血清的最佳稀释度分别为1:500、1:100、1:50。P39敏感性为75%,特异性为67.71%,受试者工作特征曲线下面积(AUC)为0.844。P62敏感性为91.66%,特异性为46.87%,AUC为0.649。混合肽P39+P62的敏感性为95.83%,特异性为97.91%,AUC为0.793。结论:1.本研究通过生物信息学对Rv3874、Rv0934、Rv3875、Rv3804c和Rv3878进行了多参数的综合预测分析,最后共筛选出五条Th预测表位肽,即P39、P50、P40、P185、P62。合成后均为高纯度表位肽。2.本研究确定了Th细胞表位肽的最佳工作浓度为40μg/ml,P39和P62是候选的新疆汉族人群结核分枝杆菌免疫优势Th表位多肽。3.本研究发现P39、P62及混合肽P39+P62均具有良好的免疫原性及免疫保护性,在检测外周血结核Ig G抗体中联合运用P39、P62诊断价值升高,可为加快研制结核病特异性诊断试剂、设计重组卡介苗菌株及研发新型结核病疫苗提供依据。
其他文献
目的:本论文以松针精油作为青贮添加剂,研究松针精油对苜蓿青贮品质的影响,并以青贮饲料中的嗜酸乳杆菌、串珠镰刀菌和梭状芽孢杆菌作为指示菌种,探索松针精油的抑菌效果和抑菌机制,从而初步阐明松针精油对苜蓿青贮品质及微生物的影响。方法:本论文共分为三个试验,具体方法如下:试验一:松针精油对苜蓿青贮品质的影响。苜蓿鲜草于6月份初花期(第二茬)收割,凋萎3小时。试验分4组进行,在苜蓿中分别添加0 mg/kg(
秋萌,即种子可以在秋季萌发,这类植物称之为冬季一年生植物,在荒漠区多样性维持和防风固沙等生态功能上发挥着重要作用,尤其在气候变化背景下,冬季一年生植物盖度和密度增加,在群落中占有越来越重要的地位。因此,研究种子秋萌的形成机制,为进一步预测气候变化下荒漠植被动态和丰富温带沙漠冬季一年生植物种子萌发策略具有重要意义。我们在野外调查发现尖喙牻牛儿苗(Erodium oxyrhynchum)是准噶尔荒漠中
目的:本试验旨在筛选与布鲁氏菌分泌蛋白BspA互作的细胞靶蛋白,并研究BspA与宿主细胞靶蛋白互作过程中的生物学功能,揭示布鲁氏菌分泌蛋白BspA调控细菌胞内寄生的分子机制,为布鲁氏菌致病机制的研究奠定基础。方法:(1)利用卡纳抗性替换的方法构建布鲁氏菌分泌蛋白BspA缺失株,并利用生物信息学软件对BspA进行生物信息学分析。通过TMHMM Serverv.2.0在线软件对BspA蛋白质跨膜结构域
目的:牛梨形虫病是指一类经硬蜱传播,由梨形虫所引起的血液寄生虫病的总称,主要引起宿主贫血消瘦,产量下降,严重时可导致宿主死亡,对畜牧业造成了极大的经济损失。小海子垦区作为新疆生产建设兵团第三师三大垦区之一,也同样深受着牛梨形虫病的困扰。本研究通过对小海子垦区及周边不同地区牛血样和硬蜱及其携带梨形虫进行分子检测,来确定垦区梨形虫及媒介蜱具体种类,揭示垦区梨形虫和媒介蜱的种群地理分布,为牛梨形虫的防控
目的:明确新疆不同地区向日葵列当的寄主范围,为采用农业防治措施防治向日葵列当提供依据。通过评价不同食葵品种(系)应对向日葵列当的抗性水平,再测量其中两个抗性不同的向日葵品种在向日葵列当侵染后的生物量及生理生化的影响和差异基因表达的影响,分析向日葵抗列当寄生的生理生化和分子机制,为新疆向日葵抗列当育种和防治措施提供参考。方法:采用盆栽法将新疆四个地点采集的向日葵列当种子与9科21种植物共培养,根据不
风干牛肉是新疆哈萨克族的传统特色发酵肉制品,因其独特的香气和质地而广受欢迎。肉制品的质地基本上由蛋白质的状况决定,制作过程中强烈的体积收缩、质地改变以及风味的形成,都与蛋白质的构象改变引起的功能性质改变密切相关。本研究以风干牛肉为研究对象,接入产蛋白酶乳酸菌进行发酵,从蛋白的降解、氧化及结构特性三方面着手,探究发酵过程中牛肉蛋白的变化趋势,旨在更深入地了解风干牛肉品质的变化机理,为确保风干牛肉的安
单核细胞增生李斯特菌(Listeria monocytogenes,LM)是一种食源性的胞内致病菌,可以感染人类和动物,引起脑膜脑炎、流产和败血症等疾病,死亡率可高达20%-30%。各国每年对食品LM的污染调查结果显示,鸡肉中LM的检出率在1.1%-5.51%之间,鸡肉源LM可能是加工环境污染,也可能是鸡本身携带。目的:本试验将研究鸡肉源LM对鸡的致病性,以引起食品厂和养禽场对污染源的重视。并通过
目的:评估心肌梗死患者的健康相关生活质量现状,进一步分析探讨其影响因素,以期为未来临床实践中制定有针对性提高心梗患者健康相关生活质量的多水平干预措施提供实证依据。方法:问卷调查方法:采用整群抽样法,抽取新疆某2所三甲医院2020年4月至10月在心内科就诊的457例心梗患者,利用一般资料调查表、心肌梗死多维度量表、医学应对方式量表、心理一致感量表和疾病感知问卷进行问卷调查。统计分析方法:使用Epi
目的:明确北方蚁影响下,蚁巢及周围土壤理化性质的变化特征、蚁巢筑巢材料浸提液对种子萌发和幼苗生长的化感作用、蚁巢及周围土壤种子库组成特征,最终探究蚁巢对植物群落结构产生的影响。方法:2019年8月在温性荒漠草原、温性草原、山地草甸中分别寻找北方蚁蚁巢。(1)以蚁巢正中心为原点,在0、50、100、150、200及500cm外(CK),取20cm深的土壤,测定土壤含水率、p H值、有机质、全氮、全磷
目的:1.检测种植体周围炎及健康样本的种植体周围沟液(Peri-implant crevicular fluid,PICF)中MMP-8、MMP-7、MUC-4的表达水平;2.分析MMP-8、MMP-7、MUC-4水平与种植体周围临床指标的关系;3.初步探讨新型标志物组合MMP-7和MUC-4在PICF中是否具有区分种植体周围疾病与健康个体的能力,以期为寻找辅助种植体周围疾病诊断、评估和治疗的新型