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废水污染问题是制约发酵行业发展的因素之一。本实验室在生态营养链理论的基础上，以乙醇发酵为切入点，提出了乙醇沼气双发酵耦联工艺。这为发酵废水治理提供了新的解决方案，也为液态深层发酵行业的绿色制造提供范例。实验室与中试规模的运行结果证明了乙醇沼气双发酵耦联工艺的可行性，化学需氧量（COD）、氨氮、硫酸根、碱度、挥发酸（VFA）、固体悬浮物（SS）等是影响乙醇沼气双发酵耦联工艺稳定运行的关键因子。本文重点对硫酸根、氨氮、SS三个因子进行调控，并在此基础上进一步研究工艺的运行规律。本文主要研究结果如下：（1）采用中温厌氧出水配料时，需要调节料液pH以达到液化酶的最佳作用pH，引入大量的硫酸根离子，蒸馏废水中硫酸根的最高浓度可达3.18g/L。如此之高的硫酸根浓度对沼气发酵极为不利。采用氢氧化钙沉淀可将蒸馏废液中的硫酸根浓度控制在2.12g/L以下，并减少料液pH调节时33%左右的硫酸使用量。采用10%蒸馏废液回用法调控硫酸根，可减少8.02%的硫酸使用量。（2）氨氮会在乙醇沼气双发酵耦联工艺中随着工艺的运行而累积。在实验室及中试规模的运行中，氨氮的最高浓度可以分别累积到811mg/L和1100mg/L。实验室规模时，当厌氧出水中的氨氮浓度高于550mg/L时，酒精发酵会受到抑制。通过脱氨手段将氨氮控制在350mg/L以下时，酒精发酵恢复正常。中试规模中，通过升温通风、鼓泡池脱碳脱氨塔脱氨等手段将厌氧出水中的氨氮控制在300mg/L以下时，酒精发酵不受其抑制。（3）中温厌氧出水中，悬浮物以污泥为主。污泥含量高导致酒精产量下降、干酒糟饲料DDG质量下降，以及DDG色泽加深。采用絮凝方法去除污泥时，阳离子型聚丙烯酰胺（CPAM）絮凝效果最好，最佳絮凝条件为pH10、温度50℃、添加量40mg/L。中温厌氧出水中残存的絮凝剂不会对酒精发酵产生影响。（4）以木薯为原料时，循环中的酒精产量平均为（11.97±0.95）%（v/v），高温及中温厌氧出水的COD分别为4624±1632及2605±579mg/L。沼气发酵稳定运行时，高温及中温厌氧出水中的挥发酸分别为400-500mg/L及小于200mg/L；碱度分别为2000-4000mg CaCO3/L及3000-5000mg CaCO3/L。以玉米为原料时，酒精产量出现小幅度波动，中温厌氧出水中污泥含量过高是导致酒精产量波动的主要原因。工艺运行中，高温及中温厌氧出水的COD分别为4307±1185mg/L及2656±986mg/L；碱度分别为4527±518mg CaCO3/L和3949±721mg CaCO3/L；氨氮分别为618±201mg/L及478±165mg/L；VFA分别为213mg/L及50mg/L左右。实验室规模实验表明（11批循环），中温厌氧出水中的SS浓度低时酒精产量稳定。