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柑橘属(Citrus)由林耐1753年订立,系芸香科(Rutaceae)柑橘亚科(Aurantioideae)植物。在过去250余年的时间里国内外学者对柑橘属植物的分类和系统发生关系从形态到分子开展了一系列研究。然而,现有的柑橘分类系统在亚属划分和种的数目等问题上分歧依然很大。柑橘属植物系统进化的基本框架(即原始野生类型的种类、起源及其系统进化关系)迄今仍不清楚。Swingle(1943)年,根据雄蕊数目及汁胞构造将柑橘及其近缘的五个属,枳属(Poncirus)、金柑属(Fortunella)、澳枳檬属(Microcitrus)、澳砂檬属(Eremocitrus)、多蕊檬属(Clymenia)一起划分到真正柑橘果树类。由于柑橘芽变、栽培历史悠久以及与近缘属之间的有性杂交等因素,柑橘及其近缘属植物之间的分类和系统进化关系迄今仍无定论。柑橘类果树具有很高的经济价值,准确地弄清柑橘属的分类及其与近缘属植物之间的系统进化关系,对柑橘属植物的遗传育种、种质资源的深入研究、保护和利用都具有重要的理论和实践价值。植物叶绿体基因组分子量小、进化相对保守、单亲遗传、在绝大多数被子植物中是分析母系遗传关系的理想数据。本论文以九里香属(Murraya),酒饼勒属(Atalantia)和蚝壳刺属(Severinia)作为外类群,对真正柑橘果树类30个生物型的3个叶绿体DNA(cpDNA)片断(PsbH-PetB,TrnL-TrnF和TrnS-TrnG)进行了序列分析,并用利用PAUP~* version 4.0b10软件构建了最大简约树。最后得到的严格一致性树表明,真正柑橘果树类的六个属构成单系类群,得到100%的统计支持。在真正柑橘果树类内部6属植物形成四个分支:(1)枳属(Poncirus)的三份材料形成一分支,得到100%统计支持:(2)金柑属(Fortunella)的全部材料形成一独立的分支,得到100%统计支持:(3)沙橘(E.glauca)、圆果指橘(M.australis)、多蕊檬(Cly.polyandra)、枸橼(C.medica)和佛手(C.medica.var sarcodactylis)形成一分支,得到100%统计支持;(4)M.australasica和剩余柑橘属植物构成一支,得到97%的统计支持。最后,我们对柑橘及其近缘属植物间的系统进化关系进行了详细的讨论。