五个与肾透明细胞癌患者预后显著相关lncRNA的发现

来源 :华东师范大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yellow1989
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癌症是一种形成原因特别复杂的慢性疾病,遗传方面的因素、生活环境的好坏都可能会决定个体是否会患上癌症。近期的一些研究报道表明,lncRNAs(long non-coding RNAs,长链非编码核糖核酸)在肿瘤发生过程和癌症患者的预后中扮演重要的角色,由此激发了人们对lncRNAs在癌症预后中具有潜在临床相关的作用及机理进行了一系列研究。肾细胞癌(简称肾癌)是人体泌尿系统器官中恶性度较高的一种肿瘤,也是人体所有肿瘤中最常见的肿瘤之一,起源于肾实质泌尿小管上皮系统的恶性肿瘤,又被称为肾腺癌,占所有肾恶性肿瘤的85%~95%。通常病理学家将肾细胞癌分为4种类型:肾透明细胞癌、乳头状肾细胞癌、嫌色细胞性肾细胞癌以及Bellini集合管癌。其中,绝大多数为肾透明细胞癌,占肾癌的70%~80%,其癌细胞常排列成片状、条索状、腺泡状或管状。然而,lncRNAs标记作为一种生物标记在肾透明细胞癌(ccRCC,clear cell renal cell carcinoma)患者的预后中起什么样作用,尚未被深入研究和讨论。因此,我们试图去寻找与肾透明细胞癌患者预后显著相关的一些lncRNAs。首先,我们在癌症和肿瘤基因图谱计划公共数据库(TCGA)中,提取了带有临床信息数据的440个肾透明细胞癌患者数据,并对这组数据中lncRNAs的表达值进行分析。在对总的数据集分组后的训练集以及测试集中,我们发现并验证了五个与肾透明细胞癌患者预后显著相关 lncRNAs(AC069513.4、AC003092.1、CTC-205M6.2、RP11-507K2:3、U91328.21)。基于这五个预后相关的lncRNAs,样本中的肾透明细胞癌患者可被分为高风险和低风险组两种组别。其中,存在于不同组别的患者的存活率明显不同。多变量Cox回归分析表明,这五个预后相关的lncRNAs具有相对于其他临床因素而言的独立的预后价值。进一步的功能富集分析还显示出这五个预后相关的lncRNAs在肿瘤形成过程中所发挥的潜在作用。所有的生存分析的结果都表明,这五个预后相关的lncRNAs对于肾透明细胞癌患者预后来说,很有可能作为一个独立而又重要的生存指标。
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