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利用微卫星(SSR)标记对我国4个省内的6个桂花(Osmanthus fragrans (Thunb.) Lour.)野生居群122个个体的遗传多样性进行了研究。从前期设计的29对引物中筛选出了6对多态性高的引物,揭示了桂花丰富的遗传多样性：平均等位基因数目(A)平均为6.167个,有效等位基因数目(Ne)平均为4.113个,平均期望杂合度(HE)为0.691,Shannon(香农)信息指数(Ⅰ)平均值为1.454。桂花维持着较高水平的居群内和物种水平的遗传多样性(HT=0.814,HS=0.720)。这种较高的遗传多样性可能与其生活史特征和地理分布有关。分子方差分析的结果显示只有小部分变异存在于居群间(13.17%),大部分遗传变异存在于居群内(86.83%)。Mantel检验表明自然居群间遗传距离与地理距离并不存在显著相关性(r=-0.268,P=0.216),揭示出桂花野生居群的分化现状可能是其生活史特性、地理隔离与人为破坏综合作用的结果。这些遗传信息为桂花野生资源的保护和利用提供了一定依据。