内蒙古地区臭柏种群遗传分化的RAPD分析

来源 :内蒙古农业大学 | 被引量 : 4次 | 上传用户:davidphoenix
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应用随机扩增多态性DNA(Random Amplified Polymorphic DNA,RAPD)标记法研究了内蒙古地区臭柏种群的遗传分化,经Popgen32 Version1.31统计分析,结果如下:用18条引物对臭柏4个种群进行扩增,共检测到124个位点,其中多态位点100个,多态率达80.7%.种内的Neis多样性指数和Shannons多样性指数分别为0.286和0.428,各种群内的平均多样性值分别为0.232和0.347,各种群的多样性变化趋势为毛乌素沙地(0.258,0.386)>阴山山脉西段(0.258,0.376)>浑善达克沙地(0.231,0.345)>贺兰山(0.184,0.281).臭柏种群总的基因多样性(Ht=0.288)大于种群间的基因多样性(Hs=0.233),种群间的遗传分化系数Gst=0.183,即种群间有一定的遗传变异,占总遗传变异的18.3%,种群内的遗传变异占总遗传变异的81.7%.4个种群之间有比较相似的遗传多样性,由于地理隔离,也存在着一定的种群间分化.臭柏种群间的平均遗传距离为0.0865,平均相似性系数为0.91 81,根据遗传距离进行UPGMA聚类,毛乌素沙地和阴山山脉种群在1.928处相聚;浑善达克沙地与它们在2.366处相聚;然后它们与贺兰山种群在6.426处相聚,当把阈值取到2.4时,就可以聚为两类了,这主要与它们的生境有关.
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