不同盐环境嗜盐古菌比较分类学研究

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中国丰富的高盐环境资源中蕴藏着极其多样的嗜盐古菌类群,这些物种是嗜盐古菌分类学以及嗜盐古菌应用研究的珍贵资源。本文主要研究新疆维吾尔自治区塔里木盆地的6个盐环境——塔河河滩盐碱地、五团盐碱地、南口农场排碱渠、胜利水库、六团盐碱地与和田沙漠公路——可培养嗜盐古菌多样性,分析其群落结构,通过多相分类学研究并确定未知类群的分类学地位,并对Haloterrigena属、Natrinema属及其相近类群的嗜盐古菌进行比较分类学的初步探索。  基于16S rRNA基因序列分析与系统发育分析表明,分离自塔河河滩盐碱地的50株嗜盐古菌分别属于12个属的25个分类单元;分离自五团盐碱地的58株嗜盐古菌分别属于15个属的25个分类单元;分离自南口农场的48株嗜盐古菌分别属于14个属的21个分类单元;分离自胜利水库的45株嗜盐古菌分别属于10个属的16个分类单元;分离自六团盐碱地的60株嗜盐古菌分别属于20个属的29个分类单元;分离自和田沙漠公路盐土的51株嗜盐古菌分别属于17个属的28个分类单元。选择有代表性的嗜盐古菌进行多相分类学研究,结果表明,分离自六团盐碱地、胜利水库、塔河河滩、南口农场的7株嗜盐古菌属于6个新分类单元(3个新属和3个新种),分别为Halofumussalinus NK13、Halofumus salinus NK23、Haloflexus salinus TH-33、Haloparvus salinusLT-12、Haloterrigena xinjiangensis LT-55、Natrinema xinjiangense LT-61和 Natrinematarimense SLN-56。  基于多基因系统发育分析表明,Haloterrigena属和Natrinema属的属级界定不清晰。基于16S rRNA基因和rpoB基因的系统发育结果表明,来自Haloterrigena属和Natrinema属的主要成员相互交错聚成一个独立的分类单元,而Haloterrigenadaqingensis则与Natronorubrum sediminis聚为一支,可能属于Natronorubrum属的成员;基于EF2基因的系统发育结果表明,除了Haloterrigena daqingensis之外,Haloterrigena hispanica和 Haloterrigena limicola也可能属于Natronorubrum属。  极性脂组分分析结果表明,Haloterrigena属和Natrinema属的嗜盐古菌的磷脂组分均含有PG和PGP-Me,其PG均包含C20C20和C20C25两种磷脂酰甘油衍生物,部分嗜盐古菌还含有PA;Haloterrigena属和Natrinema属的嗜盐古菌均含有S-DGD,Haloterrigena属中性嗜盐古菌均含有特征性糖脂S2-DGD,而Natrinema属的成员所含的糖脂组分差异较大。
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