猪CXCR7基因的克隆及CXCR4与CXCR7基因的功能预测、SNP检测及性状关联分析

来源 :华中农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wugailin
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
随着当今社会人类生活水平的提高,肉蛋奶逐渐成为人们日常生活中必不可少的蛋白质营养来源。养猪业随之成为人们日益关注的行业,如何改进母猪的繁殖性能,提高母猪的窝产仔数一直以来困扰着规模养殖场和养猪户。随着养猪生产技术的逐渐成熟,母猪的排卵数和公猪的受精率已经得到大大提高,但是仔猪的出生率和成活率远远没有达到人们的期望。妊娠期间,母胎界面的血管发育是胚胎正常发育的关键,血管发育经历两个阶段,即血管发生和血管生成。血管发生是内皮细胞在无血管的区域分化、增殖,然后结合成分散的血管。血管生成是在已经存在的微血管或毛细血管的基础上,通过内皮细胞的芽生及分支形成新的血管网。其中血管内皮生长因子(VEGF)是驱动血管内皮细胞增殖的关键因素,VEGF的增加或减少都会导致胚胎死亡,降低母猪的窝产仔数(Carmeliet,1996)。在血管内皮细胞中,VEGF能够上调CXCR4的表达,二者协同CXCL12介导血管内皮细胞的迁移,而CXCL12又可协同VEGF介导血管内皮细胞的增殖,并且还可以防止血管内皮细胞的死亡。(Kryczek,2005)。本实验采用生物信息学的方法和分子生物学的手段,对猪趋化因子CXCL12和CXCR4进行了表达特征分析,重点对CXCL12的受体CXCR7基因进行了分离,并对CXCR4和CXCR7基因进行了功能预测、SNP检测、性状关联分析和电子定位。获得以下结果:(1)通过NCBI相关数据库公布的猪CXCL12和CXCR4基因的cDNA序列,采用DNAMAN生物学软件获得蛋白序列,并发现不同物种间进化上具有高度保守性。(2)采用NCBI相关数据库人CXCR7基因的cDNA序列获取猪的ESTs,使用DNAStar、Primer 5.0等生物学软件及PCR扩增分离得到猪CXCR7基因的CDS序列,并预测了蛋白序列,并发现不同物种间进化上具有高度保守性。(3)通过生物信息学的方法预测了猪CXCR4和CXCR7基因的功能结构域,即具有GTP蛋白偶联特征结构域。(4)采用RT-PCR的方法对猪CXCL12和CXCR4基因在成年妊娠26天梅山母猪各个组织中的表达特征进行了初步探讨,发现呈广泛表达模式。(5)采用RFLP-PCR方法对猪CXCR4和CXCR7基因的SNP进行了筛查,在CXCR4的第二外显子上发现一个SNP位点,CXCR7的第二外显子上发现两个SNP位点,这两个位点在本实验所检测的猪群中呈现连锁不完全平衡。进一步关联分析发现猪CXCR4基因g.189T>C位点与0日龄红细胞数、0日龄平均HGB含量和0日龄血小板体积存在显著关联(P<0.05);猪CXCR7基因g.181G>C位点与0日龄红细胞数、0日龄白细胞数和0日龄PLT分布宽度存在显著关联(P<0.05)。(6)利用生物信息学方法及相关的网站和数据库对猪CXCL12、CXCR4和CXCR7基因进行了染色体的电子定位,猪CXCL12、CXCR4和CXCR7基因分别定位于Sscr14q2.4、Sscr15q1.2和Sscr15q2.6。
其他文献
本文分析了造成大体积混凝土出现裂缝的原因,重点对建筑工程大体积混凝土浇筑施工技术的要点进行了深入探讨,以供参考.
随着我国科学技术的快速发展,相关行业也越发完善和成熟,科学高效的焊接技术作为核电设备制造与安全运行的关键环节,受到了核电领域的广泛关注,使其应用现状与发展前景成为了
该系统在模型选择时,采用的是模糊线性规划模型,对约束方程右边的饲养标准值bi,采用“近距离”的方法,使优化后的配方指标含量无限的接近或近似等于bi,“近距离”是一个模糊
目前转基因植物的安全性评价在世界各国还没有一个统一的标准,一般地说,转基因植物的检测方法主要从三方面进行考虑:一是核酸水平的检测,包括PCR扩增技术、点杂交、Southern杂
随着城市化进程的不断发展,这势必会带来能源消费的增长,目前我国的能源问题十分严重,能源利用率低、能源短缺问题已经成为制约社会可持续发展的障碍.因此,我们要树立节能意
目前我国经济建设发展迅速,道路桥梁建设为我国经济发展奠定了坚实的基础.在道路桥梁施工过程中,大体积混凝土裂缝尤为常见,混凝土产生裂缝不仅影响建筑美观,而且降低了建筑
尚义县位于河北省西北部的坝上高原地区,马铃薯是当地主要的粮菜兼用栽培作物,但长期以来,由于病毒病的为害,使得马铃薯种性严重退化,每年因病毒病减产都在30%以上。为了加快脱毒马
摘 要:结合国家相关设计规范,标准以及作者的工程实践,提出了高层建筑电气设计中常遇到的一些问题和具体处理方法。  关键词:变配电所 计费 应急照明 ATS 节能 消防  中图分类号:TM1文献标识码:A 文章编号:1007-3973 (2010) 03-026-02  随着我国经济技术不断发展,高层建筑层出不穷,建筑规模越来越大,建筑电气设计理念和技术也在不断更新和发展,同时,随着新的《民用建筑电
该试验研究以广东省现行的家蚕品种湘晖、7532、932、芙蓉为材料,进行小蚕人工饲料育的研究.采用16﹪、26﹪、36﹪、46﹪四种不同比例桑叶粉含量的小蚕人工饲料喂饲小蚕.大豆粉的醚溶
近些年来,随着我国建筑事业的快速发展,人们对混凝土的施工技术与质量管理逐渐重视起来,这是因为混凝土的施工在整个工程项目施工中占有重要的位置,其施工技术的好坏与质量管