结核分枝杆菌环介导等温扩增实时荧光与反向斑点杂交检测方法的研究

被引量 : 4次 | 上传用户:yjxff520
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
结核病是一种严重威胁人类健康的传染病,是我国重点防控的疾病之一,也是全世界重点关注的公共卫生和社会问题。据世界卫生组织(WHO)统计,全球目前约有860万人罹患结核病,130万人死于结核病。结核病的发病率以平均每年增加0.4%的速度增长。因此,寻找一种快速准确的结核分枝杆菌检测方法已刻不容缓。近年来兴起的环介导等温扩增技术具有快速、敏感性高、特异性强等优点,而反向斑点杂交技术结合了基因扩增与分子杂交两项技术,可准确、直观的观察结果,操作简便。本研究建立了结核分枝杆菌环介导等温扩增技术和反向斑点杂交技术,可以满足现场快速检测的需求,为结核病的防控提供了技术支持。本研究分为四部分:第一部分:结核分枝杆菌插入序列IS6110基因的克隆与序列分析选择结核分枝杆菌特异性较好的插入序列IS6110片段作为靶序列,根据GenBank上公布的的结核分枝杆菌IS6110序列(GenBank登录号为:X17348.1)设计一对特异性引物。将PCR扩增后的目的片段与pGEM-T载体相连接,连接产物转化至大肠杆菌感受态细胞,通过蓝白斑筛选得到克隆质粒pGEM-T-IS6110。克隆质粒经PCR及测序鉴定,结果证实获得了结核分枝杆菌IS6110基因。第二部分:结核分枝杆菌环介导等温扩增实时荧光检测方法的建立针对结核分枝杆菌特有的插入序列IS6110,自行设计并合成结核分枝杆菌的环介导等温扩增引物组(包括一对外引物以及一对内引物),将引物组中的各引物按照一定的摩尔浓度比例配制成引物组溶液,并利用环介导等温扩增实时荧光检测系统建立结核分枝杆菌的环介导等温扩增检测方法,同时对内外引物摩尔浓度比例、反应温度进行优化得到最佳反应条件,结果通过环介导等温扩增实时荧光曲线进行分析。通过分析环介导等温扩增实时荧光曲线可知,整个反应用时1h,大多数反应在30min内开始扩增。同时,对10倍梯度稀释的结核分枝杆菌DNA模板进行检测,环介导等温扩增实时荧光检测方法检测限可达2.4fg/反应,比PCR高100倍,对其他常见病原菌的DNA无检出,灵敏度和特异性均较好,具有广阔的临床应用前景。第三部分:结核分枝杆菌反向斑点杂交检测方法的建立针对结核分枝杆菌特有的插入序列IS6110,自行设计并合成生物素标记引物及特异性寡核苷酸探针。以结核分枝杆菌DNA为模板,通过PCR扩增,制备生物素标记的目的片段,产物变性与固定在带正电荷的尼龙膜上的特异性寡核苷酸探针在65℃进行杂交,每次杂交反应设有阳性对照及阴性对照。通过对探针浓度、链酶亲和素标记碱性磷酸酶的稀释倍数、杂交时间、酶促反应时间四方面进行优化得到反向斑点杂交的最优反应条件,结果通过对膜显色后是否出现蓝紫色斑点来判定阳性或者阴性。本研究建立的反向斑点杂交的特异性好,与其他常见病原菌无交叉反应,对10倍梯度稀释的结核分枝杆菌DNA模板进行检测可达到24fg/反应的检测限。与PCR相比,该方法的检测限提高了10倍,可实现结核分枝杆菌与其他常见病原菌的鉴别诊断。第四部分:环介导等温扩增实时荧光检测方法与反向斑点杂交方法在临床标本中的应用以临床上确诊为结核病患者的痰标本的DNA为模板,分别进行环节导等温扩增实时荧光检测和反向斑点杂交检测。所有痰标本均出现荧光扩增曲线并出现蓝紫色斑点,该结果表明本研究建立的环介导等温扩增实时荧光检测结合反向斑点杂交方法可成功的检测出结核分枝杆菌,该方法灵敏、特异,不需要精密仪器,适合在临床实验室推广使用。
其他文献
对短波直扩系统的射频单元、扩频单元及双AGC技术进行了较详细的讨论,列出了实时采集的接收机天线及中频输出频谱图,对在短波直扩过程中遇到的一些关键性的问题进行了总结。
随着汽车产业的快速成长,传统的燃油发动机汽车带来的环境污染与能源危机问题日渐凸显,新能源汽车成为未来汽车工业的重要发展方向之一。以电动汽车为代表的新能源汽车要代替
心理治疗与积极心理学之间存在着功能与普遍意义上的联系,积极情绪的扩展与建设理论认为积极情绪对于保持心理恢复力、增强心理健康和生理健康等方面具有重要作用,积极情绪视
目的 分析卒中患者的高血压危险因素、并发症及病死率,为防治卒中提供参考依 据。 方法 对3059例住院卒中患者进行回顾性分析,统计患者的一般情况、高血压、并发症及 病死
本硕士学位论文认真研读学者仁钦道尔吉提出的蒙古史诗发展变异规律的基础上,进一步深入其研究,并提出了自己的观点。本文通过辨析巴尔虎史诗中的蟒古斯母题、蟒古斯形象的描
随着中国经济持续高速增长,企业职工的工资水平明显得到提升。然而,在城镇居民收入不断提升的同时,城镇劳动力市场中一直存在严重的国有部门和非国有部门之间的市场分割。本文在
西汉李陵是中国历史上一位典型的降将、贰臣,也是一位大节有亏却获得普遍同情的悲剧英雄人物。以司马迁《史记》、班固《汉书》为开端,李陵故事在历时性的接受中积淀成为一个具
目的:探讨电针预处理对脑缺血/再灌注小鼠海马及皮质区神经元单磷酸腺苷激活蛋白激酶(AMP-activated protein kinase,AMPK)、神经行为学评分、神经元凋亡及其凋亡蛋白Bax、casp
《平原》是毕飞宇继《玉米》之后的又一部长篇力作。小说一如既往地继承了毕飞宇冷峻洒脱而又不失温情的笔触,将上个世纪70年代发生在苏北平原上的悲喜交加的故事向读者娓娓