白细胞分化抗原109(Cluster of differentiation109,CD109)是一种细胞表面抗原,为糖基化磷脂酰肌醇(Gtycosylphosphatidylinositol,GPI)联结的糖蛋白,属于含硫酯的α2-巨球蛋白家族/补体C3,C4,C5(α2-macroglobulin/complement,AMCOM)超家族成员。在人的某些癌组织标本中检测到CD109表达水平上调,特别是鳞状细胞癌。因此,CD109可能成为诊断和治疗肿瘤有用的分子靶标。关于CD109的高级结构,结构与功能之间的关系,系统发生学关系,在正常细胞和组织中的功能和在肿瘤的发生和发展中的作用机制等还有待进一步深入研究。　　 日本七鳃鳗是一种典型的最古老的无颌类脊椎动物,被认为是处在进化出适应性免疫系统的边缘,是一种很好的模式生物。目前还没有报道日本七鳃鳗CD109基因,因此研究日本七鳃鳗CD109基因,可以为阐释CD109的结构和功能以及作用机制提供参考。　　 本文利用日本七鳃鳗白细胞EST,采用RACE方法从健康成年日本七鳃鳗白细胞中克隆得到了日本七鳃鳗CD109全长cDNA序列。并构建日本七鳃鳗CD109原核表达载体。日本七鳃鳗CD109的cDNA序列全长为4986bp,含有一个4218bp的开放阅读框,5’端非编码区长114bp,3’端非编码区长652bp,编码1405个氨基酸残基。经生物信息学分析,日本七鳃鳗类CD109含有信号肽,是一种分泌型的糖蛋白,具有α2巨球蛋白/补体超家族所特有的硫酯基序,其C端具有潜在的糖基酰磷脂酰肌醇锚定位点,有16个潜在的N-糖基化位点,不含有典型的疏水区和跨膜区。进化树构建结果表明:日本七鳃鳗CD109与其他α2巨球蛋白/补体超家族中CD109具有最近的亲缘关系。功能预测结果表明该蛋白质参与细胞的免疫应答。这些实验结果和预测结果为进一步研究日本七鳃鳗CD109的生物学功能奠定基础。