本文利用浙江省11个市89个地区的民营企业科技资源投入和产出的普查数据，对其科技资源投入和产出现状进行了整体分析和比较分析，接着运用数据包络分析法（DEA），测算它们的科技资源配置效率，在此基础上，对影响浙江省民营企业科技资源配置效率的因素进行了回归分析。　　研究发现：各个地区的民营企业科技资源配置效率差距较大，大部分地区科技资源配置技术无效且规模无效，而且处于同一个市的不同区县，其科技资源配置效率也有较大的差别。其中，衢州市、金华市、杭州市、台州市和温州市这5个市的大部分区县都存在投入冗余问题。而存在产出不足的有宁波市的北仑区和奉化市、金华市的永康市和开化县、台州市的路桥区和温岭市。浙江省充裕的科技资源投入对于民营企业来说，并没有取得相应的科技产出，浪费了一些科技资源。　　通过回归分析发现，企业办科技机构的质量、科技资源配置结构和政府对企业科技活动的支持这三个方面的因素显著影响浙江省民营企业的科技资源配置效率。其中，对浙江省民营企业科技资源配置的效率影响最为显著的是科技资源配置结构。在模型中主要表现为人员经费占企业内部科技经费支出的比重和全时人员占科技人员比重这两个指标对浙江省民营企业科技资源配置效率值影响显著。说明浙江省民营企业的科技资源配置效率低下的一个重要原因是科技资源配置结构的不合理，具体表现为科技活动人员结构和科技经费支出结构。　　基于上述研究结论，本文给出以下建议，认为浙江省民营企业应该提高科技资源投入的有效性，优化科技经费支出的结构，并建立企业主导的产学研协同创新模式，同时，政府也应该加强对民营企业科技创新的支持力度。