N段无半胱氨酸C端剪切型Npu DnaE的构建及Npu DnaE C段酶解稳定性的改良

来源 :上海交通大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lsssml1990
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
背景及目的:内含肽(Intein)是位于前体未成熟蛋白中的一段具有自我剪接功能的多肽序列。相比连续型内含肽,断裂内含肽具有抑制不可控的提前剪接、剪切的天然优势,常被用于蛋白质纯化、蛋白质连接、毒素蛋白的生产等领域。Npu DnaE是一种来源于念珠藻(Nostoc punctiforme,Npu)的断裂型内含肽,具有高效、快速的蛋白质反式剪接活性。一些研究在Npu DnaE中引入D118G突变,获得了巯基化合物依赖性的C端剪切突变体,并在此基础上开发了快速蛋白纯化系统(Split intein Mediated Ultra-Rapid Purification of Tagless Protein,SIRP),展现出了Npu DnaE内含肽在蛋白质标签纯化领域的巨大应用潜力。Npu DnaE介导的蛋白质C端剪切及反式剪接反应,高度依赖于还原剂的催化,这可能与其分子内的半胱氨酸易形成二硫键相关。本研究构建了N段无半胱氨酸的突变体Npu NC28SC59S-H和Npu NC28IC59R-H,并研究了其C端蛋白剪切反应与DTT催化的关系。文献报道,Npu DnaE的C段融合蛋白在表达纯化过程中会发生降解,这一缺陷将影响前体蛋白收率和产物纯度,进而增加了目的蛋白特别是药用重组蛋白的生产成本。本研究从Npu N和Npu C重构机制出发,构建N端融合Npu N2片段的Npu C延长突变体N2C,研究此突变体在原核表达系统中对Npu C片段的酶解稳定性的提升作用,并探讨其对剪切反应活性的影响。方法:本研究中,我们以分子生物学实验为手段,对Npu DnaE的N段和C段进行改造,以p ET28a、p ET30a为载体构建重组表达质粒,以大肠埃希菌BL21(DE3)作为表达的宿主细胞,采用一步或多步亲和层析方法进行重组蛋白纯化,采用离子交换层析法或超滤法进行蛋白质浓缩和置换反应缓冲液。经Bradford法测定浓度后,进行内含肽的剪切反应。通过SDS-PAGE凝胶电泳法和Western blot进行考察表达、纯化中Npu C段融合蛋白的稳定性,以及剪切反应结果。结果:实验中构建的纯化标签在C末端,N段无半胱氨酸的C端剪切型Npu DnaE突变体,Npu NC28SC59S-H、Npu NC28IC59R-H,在不依赖还原剂的条件下介导的快速的C端剪切反应:25℃无DTT催化下,20分钟产物生成率达50%,12小时后产率达90%。实验中构建的N段融合Npu N2片段的Npu C延长变体N2C,能显著提升了Npu C段重组蛋白表达纯化过程中的稳定性,同时与Npu N段能发生快速、高效的C端剪切反应:37℃条件,1 mmol/L DTT催化,10分钟产物生成率达到70%,30分钟达90%以上。影响C段剪切反应因素如温度、N/C比例、DTT浓度等因素考察结果显示,在考查条件下N2C延长变体内含肽的剪切反应均可以很好进行。
其他文献
具核梭杆菌(Fusobacterium nucleatum,F.nucleatum)是引起病理性口臭的主要致病菌之一,除产生挥发性硫化物(Volatile sulfur compounds,VSCs)外,形成生物膜更是其致臭的关键。由于传统治疗口臭的方法存在复发率高、副作用较多等问题,益生菌等生物疗法逐渐被研究者们关注。本研究为了筛选在口腔中性p H条件下仍能有效抑制F.nucleatum生物膜形
铃蟾肽样受体3(BRS3)是一种G蛋白偶联受体(GPCR),在生物系统中起着非常重要的作用,是潜在的药物作用靶点。由于缺少内生配体,BRS3属于孤儿受体,导致其潜在的生物学作用机制尚不清楚。为了深入了解BRS3激活所触发的信号通路及产生的生物学效应,我们采用免标记定量蛋白质组学方法研究了其在激动剂激活过程中的蛋白质组动态变化,揭示了BRS3激活后引发的关键信号通路,并对选定的信号通路进行了实验验证
全球卫星定位系统(Global Positioning System,GPS)是现阶段最为广泛应用的导航系统之一,但是以GPS为代表的卫星导航系统的工作均依赖卫星信号的稳定接收,在卫星信号受干扰的情况下则需要考虑其他导航方式。视觉/惯导组合导航系统凭借良好适应性在日常生活中被越来越广泛地应用。本文主要研究了视觉/惯导自适应组合导航方法,主要工作内容包括:(1)对视觉/惯导组合导航系统进行描述与总结
大洋海底丰富的金属矿产资源将成为未来全球矿产资源需求的主要供应来源,深海矿产资源开发利用的关键技术和装备将成为海洋工程前沿研究领域的热点。深海矿产资源开发技术的研究发展至今,管道提升式深海采矿系统已被公认为是最具有开发前景的开采方案。管道提升式深海采矿系统主要包括水面支持船、长距离垂直输运扬矿管道、水下中继站、输送软管以及海底集矿机器人。目前关于深海采矿系统总体水动力性能的相关研究较少,也尚未开展
DNA结合蛋白如何从浩瀚的基因组序列锚定DNA目标位点是一个重要的科学问题。现有模型认为,DNA结合蛋白可能通过三维跳跃、一维滑行或多种模式的协助扩散、并诱导DNA构象变化以及自身的动态构象变化锁定目标位点。胸腺嘧啶DNA糖苷酶(Thymine DNA Glycosylase,TDG)和转录因子Homeobox D9(HoxD9)可能通过上述机制识别它们的目标位点。TDG通过识别并切除错配或损伤碱
背景及目的随着代谢组学的蓬勃发展,大量数据分析方法和工具被开发并广泛使用。当前,代谢组学与其他组学的整合分析方法以及多功能的集成分析工具是该领域的热点研究方向。为了更加科学有效地挖掘海量数据中的生物医学信息,需要不断改进现有的方法,提出新的方法,开发功能齐全、性能稳定、使用便捷的平台,为基于代谢组学的机制和应用研究提供生物信息学支持。方法首先,对代谢组学数据分析各个环节的方法进行梳理和比较,采用优
荧光原位杂交(Fluorescence in situ hybridization,FISH)技术是环境微生物学研究中观察目标微生物的常用工具。然而,以海洋沉积物为代表的环境样品中,微生物细胞的体积、代谢活性限制了单个细胞内的核糖体RNA数量,因此,受信号强度限制的传统FISH难以发挥作用。另一方面,海洋沉积物中大量的非生物颗粒的存在给FISH带来了显著的非特异性结合的问题。通常,信号强度较低的问
自由流电泳是一种全液相电泳分离技术,无支持介质,它具备分析和制备两种特殊功能。这项技术被提出以来,广泛应用于多肽、蛋白质、细胞器和细胞、病毒等生物活性颗粒和分子的分离与制备。与其他电泳技术相比,自由流电泳有许多优势:(i)连续的溶质分离;(ii)由于不含吸收性基质,回收率几乎较高;(iii)温和的水环境适合酶和细胞纯化的需要,具有较高的生物活性;(iv)使用廉价的缓冲液作为分离介质,成本较低;(v
细胞的力学表型与细胞的诸多生理功能紧密关联,例如,肿瘤细胞的表面弹性信息在肿瘤形成与转移过程中表现出与正常细胞显著区别,因此其是一种潜在的具有临床检测价值的肿瘤标志物。然而,由于细胞的异质性,即使同一种类细胞也存在较大的个体细胞间力学性质差异,这导致了细胞力学性质测量结果中存在高水平的不确定度,严重影响了细胞力学表型研究结果的可靠性。为了避免上述问题,往往需要通过大量重复实验,获得统计性的可靠结果
近些年来,等离子体的物理化学特性在生物医疗、环境保护以及材料处理等领域有着越来越重要的应用,但针对生物医疗等精密应用场景,仍存在有效化学成分种类少、控制难等瓶颈问题,而针对环保等规模化应用,又存在功耗高、能效低等瓶颈问题。在上述应用中,绝大多数情况下都要求等离子体在常压空气条件下产生,等离子体中的化学物质组成基本上以源于氮、氧气的原子、分子为主,并含有微量的源于水分子的物质。而在那些主要基于化学效