“三农”问题是我国国民经济和社会发展的重中之重,2015年的政府报告中明确提出既要保证粮食安全,又要发展高效农业。农产品加工企业是现代农业发展的龙头,是农业实现产业化经营的核心。农产品加工企业是带动农业发展和保障农民收入的重要途径,是延长农业产业链和满足对农产品的多样性需求的战略举措。目前我国农产品加工企业的规模不断扩大,发展取得一定成效,但与发达国家相比仍存在一定差距。农产品加工企业的发展受到原材料、市场和经济政策等各方面影响,其中税收政策是支持农产品加工企业发展的重要手段。我国现行农产品加工企业税收政策的力度和广度都需进一步完善,存在对农产品加工企业的扶持力度不够且针对性不强等不足之处。因此,需要进一步调整和完善农产品加工企业的各项税收优惠政策。本文运用面板模型、时间序列分析和案例分析等方法,以各阶段我国农产品加工企业税收政策为基础,总结我国农产品加工企业的增值税、关税和所得税等方面存在的问题,借鉴美国、欧盟各国、日本和韩国等支持农产品加工企业税收政策相关经验,提出完善我国农产品加工企业的税收政策措施。本文主要研究结论归纳如下:第一,税收政策对农产品加工企业的积极效应具有理论基础和现实依据。不平衡增长理论、优先发展主导产业部门理论、发展极理论、供给学派的税收思想和公共产品理论为税收支持的理论依据。我国农产品加工企业的现状特征,在国民经济中的地位,与发达国家间的差距是税收政策支持其发展的现实依据。第二,税收政策对农产品加工企业的支持已取得一定效果,2003-2012年我国农产品加工企业个数的平均增长率达到3%,2003-2011年农产品加工业总产值平均增长率为24.39%,超过国民经济的增长速度。但农产品加工企业发展不仅需要良好的市场环境,更需要多样化税收优惠方式进行调节和支持。第三,我国现行农产品加工企业的税收政策主要是增值税、关税和企业所得税。本文通过对三个时期的政策分析,总结出各税收政策不足之处,如农产品范围和标准界定不清,增值税税率不一致,企业所得税优惠范围窄等问题。同时利用BCG矩阵分析农产品加工企业税负的合理性及存在的问题。第四,美国、欧盟和日韩的农产品加工企业税收政策形成了完整的体系,提供完善的金融服务体系和倾斜式的税收政策,税收优惠方式多样化,税收优惠方式随着社会经济环境的变化进行实时的调整。建立完善的税收政策支持体系可以有效促进农产品加工企业的增加收益和农产品不断创新升级。第五,通过实证分析可知,现行税收政策实施积极效应十分明显。一是农产品加工企业数量增多,规模扩大;二是农产品加工企业税负逐年递减,享受到不同程度地税收优惠,盈利能力增强;三是我国农产品加工企业的发展间接刺激农业经济发展、农民收入和就业机会增加。第六,根据我国税收支持农产品加工企业的不足之处结合发达国家促进农产品加工企业发展的实践经验,我国应从以下几个方面完善税收政策:加大税收优惠政策的力度,探索和创新税收优惠方式。进一步完善增值税、关税和企业所得税等税收政策,促进我国农产品加工企业经济效益提升和经济发展新常态。