SCA1和SCA3基因中(CAG)n动态性变化研究及在临床上的应用

来源 :中国医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jimmycjriyue
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前言 SCAs(脊髓小脑共济失调)是一大类神经退化性遗传性疾病,呈常染色体显性遗传。其病理表现多超出小脑、脊髓病变,累及脑干、神经节、视网膜、外周神经系统等,使黑质、豆状核中神经元丢失。临床症状为迟发性共济失调,如构音障碍,吞咽困难,步态不稳,眼肌麻痹等,发病年龄集中在30~40岁。SCAs的突破性进展始于1993年SCA1基因被第一个定位和克隆在6p23上,随后不到十年时间里约有十几种亚型的基因被发现,但仍有1/4~1/2的SCAs基因位点没有被定位。研究发现的SCAs大多数亚型是由CAG三核苷酸重复拷贝扩展性突变引起的,同时正常重复范围存在民族及地区的差异。并且此类疾病具有极强的临床异质性、遗传异质性、基因多效性。这使得SCAs的基因分型成为唯一有效分类方法。 SCAs在普通人群中发病率为1~5/10万,SCA1和SCA3/MJD是SCAs中发病较高的两种亚型,分别占SCAs的10~30%和10~50%。我们应用PCR放射自显影检测、荧光标记PCR及DNA序列测定相结合方法检测这两种基因中CAG重复拷贝数在部分东北人群中的分布特点,以便区分正常人与患者基因中CAG三核苷酸的突变界限,为进一步SCAs的分子水平的基因分型奠定基础,从而达到症状前诊断和产前诊断的目的。 实验材料 东北地区汉族正常人110例;临床上被诊断为脊髓小脑共济失调的具有家族遗传史的8个家系25名患者,无家族史的散发病例6个患者。每名静脉采取外周血1一5耐。实验方法 提取外周血DNA;放射自显影检测SCAI及SCA3/MJD等位基因类型;荧光标记PCR技术检测片段长度;选取基因型中纯合子进行DNA序列测定,以确定扩增片段的特异性;测定CAG重复拷贝数。实验结果 CAG在正常人群重复范围:sCAI基因为20一39次拷贝,并集中在26和27次拷贝,等位基因频率为34.09%和20.91%,杂合频率为84.55%;SCA3/MJD基因CAG扩展重复数集中在8,占整个等位基因的39.55%,杂合频率为78.18%。在8个家系25名患者中,有一个家系的一名患者被检测出SCA3/MJD基因中CAG重复拷贝发生了扩展突变,CAG重复拷贝数为62次,家系相关成员进行症状前诊断未见CAG扩展突变。讨论 SCA,及SCA3/MJD的基因中CAG重复拷贝的正常变异范围随地区民族的差异而有所不同。准确界定正常与异常的变异范围是研究的关键。本研究在临床诊断的基础上,应用分子遗传学手段检测SCAI及SCA3/MJD的基因中CAG重复拷贝数,不但确定了SCA;及SCA3/MJD的基因型分布特点,而且首次发现在我国东北地区SCA3/脚D基因中最短的CAG重复扩展数为8次拷贝。同时还发现了一个SCA3/MJD突变家系。尽管我们研究的8个家系患者及6例散发患者的表型类似,而且临床诊断相同,但基因分型相差甚远,这充分显示了SCAs极强的遗传异质性,说明基因分型已成为SCAs唯一准确有效的分类方法。 由于SCAI及SCA3/MJD基因中CAG三核昔酸高度重复,使扩增产物中GC含量显著增高,扩增条件非常重要。放射自显影敏感,对于低丰度的扩增产物能获得较清晰实验结果。将具有不同等位基因的样品带进行片段长度测定,及DNA序列测定以确保检测结果的SCAs特异性及准确性,将其它扩增片段与其对比,准确推算出CAG重复拷贝数。这样降低了实验的成本,同时也简化了实验步骤,在各医院临床实践中易于推广,具有很好的社会效益。 本研究采用放射自显影、荧光PCR技术、DNA测序等方法相结合,准确地确定了SCAI及SCA3/MJD基因中CAG三核昔酸重复扩展数在正常人群中分布,为进一步进行临床分型、症状前诊断及产前诊断打下良好基础,从而达到预防患儿出生的目的。结论 我们首次发现大量的8个CAG三核昔酸重复拷贝,是目前所发现的在scA3/MJD基因中最短的重复拷贝数,它很可能是我国东北地区特有的等位基因型。 本研究首次建立了SCAs的症状前诊断新方法还显示SCAs其它亚型有较高的发生可能性。 本研究科学地、系统地全面地总结了SCAI及SCA3/MJD基因的cAG三核昔酸重复扩展的分布特点,准确地统计出各等位基因频率、杂合频率,为将来其他SCAs亚型研究奠定了坚实的基础。
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