近年来,随着高校扩招的持续进行,高校教育由精英化教育逐渐转变为大众化教育,高校办学规模不断扩大,给统一管理带来了诸多问题,高效运行效率持续降低。相较于高校事业发展对资源的迫切需求,国家对高校逐年递增的财政投入也捉襟见肘,这就需要高校对有限的资源进行合理分配和高效率地利用,以此提高高校的运行效率和办学效益。高校二级学院作为一个多项输入和多项输出的独立单元,从资源利用率着手对其进行效率评价分析,可以在一定程度上反映高校整体的运行效率,因此,需构建一套兼具科学性和实用性的二级学院绩效评价体系,对其投入产出绩效进行量化分析。本文引入S高校作为实例,从各二级学院投入产出的角度出发,选取适当的投入产出指标,建立适合S高校二级学院的绩效评价体系,运用DEA模型计算各二级学院的超效率、纯技术效率、规模效率,以此对S高校二级学院绩效进行考评分析。