中小企业板自2004年成立以来得到了迅猛的发展，目前已经成为我国多层次资本市场体系中一个不可或缺的重要组成部分。随着中小板影响力的扩大，其公司治理结构受到越来越多的关注。尽管国内外学术界有关股权结构、独立董事比例、两职合一和高管激励等公司治理结构对公司绩效的影响问题进行了大量研究，并取得了十分丰硕的研究成果。然而，对于中小板上市公司关于该问题的研究却相对较少。因此，本文将以我国中小板上市公司作为研究对象，探究股权结构及高管激励等公司治理结构对公司绩效的影响。本文采用规范研究与实证研究相结合的方法。在总结国内外相关研究文献的基础上，以我国中小企业板上市公司为研究对象，从中选取了2009年底之前已经上市的307家公司数据进行实证检验。研究过程中采用主成分分析法、相关分析及多元回归分析的方法，分别从股权结构（第一大股东持股比例和股权制衡度）、董事会特征（独立董事比例和两职合一状况）和高管激励（薪酬激励和高管持股激励）三方面分析了我国中小板上市公司治理结构对公司绩效的影响，并进一步比较了高管薪酬和高管持股比例对公司绩效的影响大小关系。本文的研究结果表明：(1)在我国中小企业板上市公司中，第一大股东的持股比例与公司绩效之间呈现出显著的U型函数关系；股权制衡度与公司绩效之间有着显著的正相关关系。（2）两职合一与公司绩效之间存在显著的负相关关系；独立董事比例与公司绩效之间不存在显著的相关关系。（3）高管薪酬和高管持股比例都对公司绩效有积极影响，而且相对于高管的薪酬激励等常规激励方式，提高高管持股比例的股权激励方式具有更大的效果。（4）随着第一大股东持股比例的提高，高管薪酬和高管持股比例与公司绩效之间的相关性增强。最后，根据研究结论，提出完善中小板上市公司治理结构的对策：一是优化股权结构，增强股权制衡度；二是尽快实现董事长和总经理的两职分离，完善我国独立董事制度，使其积极作用能够得到有效发挥；三是在传统的薪酬激励之外，尽快完善高管持股等股权激励长效激励机制，最终实现提升公司绩效的目的。