国家审计作为国家基本政治制度的重要组成部分,通过发挥预防、揭示和抵御的“免疫系统”功能,在不断完善国家治理,实现国家可持续发展等方面发挥着积极作用。随着国家审计宏观性、建设性作用的发挥,审计项目也逐渐呈现出大型化、复杂化趋势,’审计项目原有的职能型组织结构已无法满足当前需求。数据使用较为封闭,跨部门协作较为困难,项目管理与部门管理存在冲突,项目文化建设相对滞后等一系列问题严重制约着审计工作的广度和深度,在一定程度上造成审计人力、物力、财力的无谓损失,对审计作用的发挥产生了负面影响。因而对国家审计项目组织管理模式创新的研究尤为关键和重要。本文从项目、审计项目、项目组织等核心概念入手,应用项目管理学、审计学理论全面分析了现阶段审计项目的特点、传统项目组织结构模式、当前审计项目普遍采取的组织结构模式和项目管理方法在审计项目组织过程中的技术应用。通过对比介绍美国等国外审计机关在项目组织管理模式中的创新和变革,阐述了现阶段我国审计项目组织管理方式存在的弊端,并针对弊端提出国家审计项目组织管理方式创新的三大原则,即有效实现审计目标；最大限度的调动审计资源,提高审计效率；保证组织有良好的横向沟通和纵向管理。在此基础上,文章对审计项目组织管理方式创新的一般特性进行了研究总结,提出了审计组织管理模式应向着扁平化、灵活化、网络化和虚拟化的方向发展。最后文章选取了财政大格局审计和跟踪审计这两种具有中国特色的审计项目,论述了目前采取的一些新的组织管理方式及其产生的积极影响,为审计项目组织管理创新模式提供借鉴参考。