农民专业合作社作为“十一五”期间,国家重点扶持的农业产业化组织形式,它不仅是农民利益的代表者和实现农民收益的重要载体,而且对农村的经济发展有着重大推动作用。自2007年《农民专业合作社法》实施以来,新疆各地区陆续创建了不同类型的农民专业合作社并逐步有序发展起来,整体发展势头十分强劲。新疆属于西部欠发达地区,自然条件严酷多变,少数民族人口较集中,生产基础相对落后,农民负担较重,建设社会主义新农村迫切需要一个稳定、和谐的农村政治、经济环境,特别是经济发展滞后的南疆地区。因此,构建适合新疆发展特点的农民专业合作社不仅是农业现代化发展的需要,而且是维护社会和谐与稳定的有力保障。农民专业合作社它了解农民最深切的愿望,能够在农民与政府之间起桥梁和纽带作用,通过互助合作拉近汉族与少数民族同胞之间的距离,协助政府贯彻落实各项支农惠农政策,营造和谐、稳定的社会氛围,从而促进社会事业发展,提高农民收入。但在发展中仍然存在着诸多问题,如规模小、实力弱、组织化程度低等一系列问题,这在很大程度上制约着农民专业合作社的进一步发展,也使合作社难以充分地发挥出自己应有的经济效果和市场作用。本文在对新疆南疆地区泽普县农民专业合作社发展情况进行充分调查的基础上,总结了当前南疆地区农民专业合作社发展的概况与特点,然后对现存几种模式的优劣性进行了简单的比较和分析,从而进一步分析、探讨了农民专业合作社现存的问题以及发展中的制约因素。通过这种理论与实际相结合的研究表明：新疆南疆地区的农民专业合作社是在社会主义市场经济形势下,实现传统农业向现代农业转变的一种非常有效的组织形式。但该地区的大部分农民专业合作社还存在不够规范、规模小,经济实力弱等问题,针对以上问题,作者提出了一些规范、发展壮大南疆地区农民专业合作社的对策建议,希望能对政府决策提供一些参考依据。