公立医院是维系政府、医保、药品供应、社区医疗卫生与群众的重要纽带，医药卫生体制改革发布的每项政策都需要通过公立医院来进行实施。自2009年4月的医药卫生体制改革以来，对公立医院补偿机制的改革就被当成重中之重来施行。当今我国公立医院的补偿方式主要有:政府财政补贴、医疗服务收费和药品加成收入。而现况却是，财政补助一直处于不足甚至不断降低的状态，医疗服务收费也是由政府规定的。公立医院只能依靠靠增加药品收入来补足资金的缺口。这又直接导致了病人看病贵，医院趋利性增强的现象，以致产生更多的医患纠纷。　　在本篇论文中:第一部分，描述了当前的医疗卫生体制改革的主要背景，体现出完善医院补偿机制的重要和紧迫。简单介绍了阜阳市中医院的基本情况，以及国内外成本补偿机制现状的研究，找出对我们有借鉴意义的措施。第二部分，公立医院补偿机制的相关理论概述。第三部分，安徽省阜阳市中医院成本补偿与经营现状。通过具体数据分析了医院的基本情况，成本现状。发现在医改这个大环境下，药品价格和医疗服务收费都被严格的控制，而与此同时财政补偿又不能弥补，所以医院出现亏损的可能性不断增高。第四部分是对成本补偿具体问题及其原因进行解析，主要问题有，全成本核算体系不够完善、医院偏离公立性质，出现趋利倾向、政府财政投入过少、医保制度有缺陷。第五部分是根据上文分析提出了相应对策及建议。本研究从社会公益性出发，指出公立医院存有的关键问题是缺乏监督、治理不严谨、逐利趋向比较严重，公益性实现很不充分，从此次所调查阜阳市中医院成本补偿的现状及问题，旨在为今后在阜阳市中医院成本补偿改革的方面提供合理性建议，加强公立医院公益性。因此，本研究具有很强的理论与现实意义。