杂种优势是生物界普遍存在的十分重要的生物学现象,并在多种动植物中得到成功地利用。芸薹属（Brassica）作物是杂种优势利用最为普遍的一类作物。为了更有效地利用杂种优势现象为人类服务,人们十分重视杂种优势产生机理的研究。国内外学者在近一个世纪对杂种优势机理的研究中做了大量的理论和实验探讨,在方法和指导思想上都有了明显的进步,不仅取得了一些进展,还提出了许多的学说。但是,杂种优势产生的机理仍然是一个末解之谜,还有许多问题需要深入研究。本研究以芸薹种（Brassica campestris L. , syn. B. rapa L.）的三个亚种,即白菜（B. campestris L. ssp. chinensis Makino）、大白菜（B. campestris ssp. pekinensis Olsson）和芜菁（B. campestris ssp. rapifera （Matzg.） Sinsk）等芸薹作物为研究对象,从基因表达差异入手,采用cDNA-AFLP技术,结合生理生化表现,对其杂种优势形成的分子生物学基础进行研究,获得的主要结果如下: （1） 从产量、品质、抗逆性,生理生化表现和分子生物学研究结果看,莲座期为芸薹蔬菜杂种优势表现最佳期,大部分产量性状、品质性状、抗逆性和生理生化指标在这一时期显示出最高的杂种优势。 （2） 以‘矮脚黄’白菜自交系（97-3-2）、‘黄心乌’自交系（003-27）、‘上海青’自交系（98-4-2）、‘黄芽菜’自交系（97-8-6）和‘白蔓菁’芜菁自交系（001-24）为亲本及其杂交所得6个F₁代为材料,利用cDNA-AFLP技术,分析杂种与亲本莲座期叶片的基因差异表达类型与构成主要生物学产量性状的杂种优势关系。结果表明,基因的差异表达与杂种优势的形成有密切关系,相关分析发现双亲共沉默（ABF₁）与叶片数杂种优势呈显著正相关;单亲表达沉默（UNP）与株高杂种优势呈显著正相关。 （3） 利用芸薹种的两个亚种‘矮脚黄’白菜自交系（97-3-2）ב白蔓菁’芜菁自交系（001-24）杂交建立了F₂分离群体。并从256对cDNA-AFLP引物中筛选获得42对多态性引物,通过分析F₂群体cDNA-AFLPs的分离以及连锁关系,构建了一个包括113个cDNA-AFLPs分子标记的分子转录图谱。该图谱由16个连锁群组成,图谱总长度为3045.2cM,标记间平均图距29.7cM。这是第一份利用cDNA-AFLP标记构建的白菜（B. campestris L. ssp. Chinensis）分子转录图谱。 （4） 首次利用白菜×芜菁转录图谱对F₂群体地上部主要农艺性状进行了QTL定位和QTL效应分析。控制株高的QTL共14个,分别位于连锁群1、2、3、5、6、9和15上,其中遗传效应最大的是qPH-3-5和qPH-5-1的加显上位性效应,可增加株高9.9cm。控制叶片数的QTL共11个,分别位于连锁群1、2、6、11和15上,其中遗传效应最大的是qNL-11-1和qNL-1-31的