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为选育抗黑痣病能力强、优质、高产、生育期适合内蒙古地区种植的马铃薯新品种,按照生态型差异大、优缺点互补的亲本组配原则,将品质好、早熟、产量及商品薯率高的马铃薯品种费乌瑞它(Favorita)作母本,分别以抗黑痣病能力强、适应性广、维生素C及淀粉含量较高的日本引进材料J07-6和国内育成品种陇薯3号(Longshu No.3)作父本,采用人为去雄的办法,经过授粉,获得2个组配的杂种F1代群体。在杂交种无性系一代对各单株的主要农艺性状表现进行了观测及初步选择,并利用SSR分子标记技术对长势良好的单株进行了杂种真实性鉴定。在杂交种无性系二代对各株系的生长、产量、品质等性状做了测定评价和选择,在无性系三代重点对选出的4个优良株系A1、株系A3、株系A16及株系C2的细胞遗传学特性进行了分析,在无性系四代主要对这4个优良株系的抗黑痣病能力进行鉴定,并对其生长、产量、品质等性状的遗传稳特性,以及SSR指纹特征进行了深入研究。主要结果如下:1.从43对SSR引物中,筛选出2对能用于马铃薯费乌瑞它×陇薯3号的杂交种F1和费乌瑞它×J07-6的杂交种F1单株真实性鉴定的适宜引物S7和STM1049。在DNA水平上,马铃薯杂交种单株真伪鉴别的SSR分子标记带型有双亲互补型、缺失型、父本型和母本型4类。试验从Favorita×陇薯3号杂交种F1和Favorita×J07-6杂交种F1的单株中,分别鉴定出真杂种34个和27个,SSR标记技术用于鉴定马铃薯杂交种真实性是可靠的。2.相关性分析表明,杂种F1代各无性株系的株高、茎粗、主茎数、单株结薯数、平均薯重、商品薯率与单株产量呈正相关,分枝数与单株产量呈负相关,平均薯重、商品薯率与单株结薯数呈显著负相关,茎粗、分枝数与株高呈极显著正相关。在杂交种的优良无性株系选育时,应选择植株相对高大粗壮、主茎数和分枝数及单株结薯数适中的个体。3.从2个杂交组合无性系二代中筛选出生长、产量、品质等综合表现优良的株系4个:分别是杂交组合费乌瑞它×陇薯3号的杂种株系A1、株系A3、株系A16和杂交组合费乌瑞它×J07-6的杂种株系C2。4.株系A1、株系A3、株系A16和株系C2的花粉育性变异较大,其花粉可育率变幅为11.99%~76.19%,以株系C2的花粉育性最高且花粉量较大,株系A16的花粉育性最低。5.株系A1、株系A3、株系A16和株系C2均为四倍体(2n=4x=48),其核型类型分别为2B、1B、2A和1A。株系A1和株系A3的染色体核型公式均为2n=4x=48=36m+12sm,株系A16的核型公式为2n=4x=48=28m+20sm,株系C2的核型公式为2n=4x=48=48m。6.株系A1、株系A3、株系A16和株系C2的单价体频率变幅为4.06%~53.35%,二价体频率变幅为3.45%~50.08%,三价体频率变幅为3.05%~42.70%,四价体频率变幅为4.32%~42.81%;株系A1的染色体配对构型为13.29Ⅰ+1.24Ⅱ+9.31Ⅲ+1.08Ⅳ,株系A3的配对构型为10.44Ⅰ+1.33Ⅱ+9.80Ⅲ+1.38Ⅳ,株系A16的配对构型为12.99Ⅰ+0.85Ⅱ+9.56Ⅲ+1.16Ⅳ,株系C2的配对构型为0.68Ⅰ+8.45Ⅱ+0.51Ⅲ+7.22Ⅳ。染色体各参数聚类分析表明,株系A3、株系A16和株系C2的染色体特征偏向母本费乌瑞它,株系A1偏向父本陇薯3号。7.无性系四代株系A1、株系A3、株系A16和株系C2的块茎产量稳定,其超亲优势分别为45.56%、31.75%、34.92%和50.95%。4个优良株系的干物质含量变幅为20.81%~27.53%,淀粉含量为16.72%~22.68%,其中株系A3的淀粉含量高达22.68%,为高淀粉株系;4个株系的还原糖含量为0.01%~0.08%,均为低还原糖株系;各株系的VC含量为23.41~32.42mg/100g,株系A3高达32.42 mg/100g,为高VC株系。8.用薯片接种黑痣病病菌鉴定出,株系A1、株系A3,株系C2的抗黑痣病能力较强,株系A16的抗黑痣病能力较弱。9.利用筛选出的10对SSR适宜引物,对3个优良株系A1、株系A3、株系C2及其亲本材料的基因组DNA进行PCR扩增,得到50个多态性位点,多态性位点百分率为79.37%。试验建立了3个杂种优良株系的SSR指纹图。10.选育出的3个株系及其父母本的遗传距离在0.2903~0.7647之间变动。遗传距离的平均值为0.5342,以遗传距离0.45为标准,把这3个优良株系及其父母本材料分为3类:母本费乌瑞它、株系A1和父本陇薯3号为一类,株系A3和株系C2为一类,父本J07-6单独为一类。