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本研究测定了甘肃静宁鸡、会宁鸡、民勤鸡3个地方群体共52个个体的线粒体DNA D-环高变区(mtDNA D-loop HVS-I)的序列,分析了甘肃三个地方鸡群体的遗传变异。在此基础上,结合已经提交到GenBank中的中国59个地方鸡群体(品种)的596个个体和国际家畜研究所测定的中国8个地方鸡品种的92个个体的mtDNA D-环的高变区序列,进一步开展了中国地方鸡种遗传多样性和系统发育的分析,得出以下结论:1.甘肃三个地方鸡群体52个个体的mtDNA D-环高变区397 bp碱基中,存在15个多态碱基,占总数的3.78%,分布在167碱基与367碱基之间。2.根据碱基变异界定出静宁鸡、会宁鸡和民勤鸡的单倍型数分别为6、3和3个,利用Dnasp 4.10.3软件对这三个群体的单倍型多样度(H)、核苷酸多样度(Pi)和平均核苷酸差异(K)的计算结果显示,静宁鸡的值均为最大,说明静宁鸡的的遗传多样性最丰富。3.甘肃三个地方鸡群体中共有10个单倍型,在系统发育分析中明显地分为三支。由此推断静宁鸡、会宁鸡和民勤鸡群体可能有三个不同的母系来源。4.通过对中国70个地方鸡群体(品种)740个个体的mtDNA D-环高变区397 bp碱基序列的分析,检测到了60个多态碱基,占总数的15.11%,分布在133碱基与396碱基之间。5.根据碱基变异界定出70个中国地方鸡群体(品种)740个个体共有102个单倍型,除个别群体外(狼山鸡、惠阳胡须鸡、清远麻鸡(10、11)、藏鸡和河南斗鸡(22)),大多数群体都有2个以上的单倍型。6. 102个单倍型在UPGMA树、N-J树和NETWORK网络关系中都明显地分为7个分枝,这表明现今的中国地方鸡种可能有多个母本系谱。7.这7个分枝在不同地理区域的明显分布样式和范围暗示它们可能是从不同地区起源的,例如中国地方鸡种可能分别起源于中国西南、东南等地区。