中国的传统中药作为中华五千年文明的一大瑰宝,数千年来积累了丰富的临床医学经验,在人类医学的发展史上占有举足轻重的地位。中药的活性成分以及药效作用机理是中药现代化研究的重要组成部分。利用计算机辅助药物设计理论研究中药中活性成分的药理作用,对于阐明中药多组分多靶点协同作用的机理,乃至对于中药现代化的进展都有重要的意义。在本实验中,我们利用分子对接方法对中草药丹参抗心血管疾病的有效成分进行了虚拟筛选,并对其药理作用进行了初步研究。使用Accelrys公司开发的Cerius2软件包,结合化学信息学方法对查到的中草药丹参中所含143个化合物进行了系统的研究。通过计算所有分子的特征描述符,分析了丹参中所含分子的化学空间,并与112个治疗心血管疾病的药物类药分子进行比较,为更加直观的分析两类分子在化学空间上的分布,我们利用主成分分析法将两类分子的化学空间映射到了二维空间上,结果显示在化学空间分布上除了有个别离群点外,两类分子有较大的重叠,这就说明丹参中很可能含有能够治疗心血管疾病的化合物,为我们下一步的筛选提供了依据。利用分子对接方法我们研究了这143个分子与治疗心血管疾病有关的23个靶标蛋白(37个结合位点)的相互作用,其中有20个分子与8个以上的活性位点有较好的相互作用,这一点充分验证了丹参在抗心血管疾病方面并不是作用于单一靶点而是作用在多个靶点上,这也说明了中药多组分多靶点协同作用的药效机理。我们还统计了对接得分在前20位的分子,其中有9个分子与20个以上的活性位点有较好的相互作用,而这9个分子中有5个分子均被报道具有抗菌、抗炎、抗氧化等生理活性,这些分子有可能在治疗心血管疾病方面具有较好的效果,这也充分说明我们所采用的基于分子对接的虚拟筛选技术能够帮助我们找到所需的分子。