[目的]通过分析“历代疫病数据库”中，清热类方剂中清热类药的配伍规律及方证关系，探索其潜在的治法用药关系，为中医方剂理论研究、现代临床运用及突发性“疫病”、新药研发等提供文献支持、组方思路及用药参考。　　[方法]首先将数据库中古方的中药物名、症状名、疾病名、朝代、方源等信息按国家标准进行处理，在疫病数据平台实现数据的查询以及分析格式的资料转换，根据药类、症状、朝代分别运用SQL语句提取数据，运用SQL Server 2005建立挖掘模型，分析药物间、药物-症状、疾病-症状、疾病-朝代等关联规则，并选择spss18.0对症状、药物进行聚类和因子分析，结合两者的结果，分析清热类方药在清热方中相关配伍规律和方证关系，并比较两种分析方法的优劣。　　[结果]数据库信息已完成规范数据，具有数据平台的查询和分析功能。分析清热类药物相关配伍及方证关系，总结出历代用药衍变规律。根据疫病数据库功能，得以验证古方方证关系，可为教学、临床、科研等服务。　　[结论]通过数据挖掘发现，清热方中通常根据症状对应的病机，如火热、湿热、热毒、血热选用泻火、燥湿、解毒、凉血等清热药，也有根据疾病使用专病专药；清热药的特色配伍药物除同类相须为伍外，常与泻下、利湿药，补益气阴药，解表药、活血化瘀药、温里药以及具有引经作用的药物相伍，使全方清热不伤正，寒凉不凝滞，行药力直达病所；选药与不同热型、各朝代的主要疾病衍变有关。结合专业意义比较数据挖掘方法发现，通过控制参数可运用关联规则发现常规配伍规律和支持度较小的潜在规律，但候选集较多会干扰规则的发现；因子分析可得到药-症公因子，但未知规律的发现受限于分析项的选择，分析效果较聚类佳，两种方法得出的结果可相互参考，存疑项通过考证原文释疑。平台可实现以现代疫病症状查找古方用药，挖掘药物配伍规律，提供处方参考。目前尚未攻克古方配伍研究的难点--剂量的标准化问题，且有待开发支持中医思维方式分析方剂配伍规律的专业软件。