巨桉WOX家族功能初步分析与Ces家族生物信息学分析

来源 :中国林业科学研究院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:cctv2009_33894352
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WOX(WUS-related Homeobox)基因家族是一类具有植物特有同源结构域的转录因子家族,在植物体内发挥重要的生理功能,参与茎尖分生组织的维持、胚性的起始和维持、后生器官的起始。本研究利用RT-PCR从巨桉(Eucalyptus grandis)中克隆10个含有WOX家族特征结构域(Homeobox Domain)的巨桉WOX基因。系统发育学分析结果显示:木本被子植物WOX基因家族的ancient clade存在“扩张现象”。生物信息学分析、组织表达模式分析、体外诱导生根过程的定量PCR分析结果显示:多数WOX家族成员的蛋白质理化性质和表达模式具有保守性;但巨桉EgrWOX2、EgrWOX3、EgrWUS显示出组织表达模式的多样性。此外,本研究成功构建10个巨桉WOX基因的超表达载体,为深入研究巨桉WOX基因的功能及其参与的分子调控机制奠定基础。纤维素合酶(Cellulose synthase, Ces)负责催化纤维素的合成。本研究利用Phytozome网站对巨桉全基因组进行全面检索,共发现31条蛋白质序列属于Ces家族,其中包括18个CesA亚族成员和13个CslD亚族成员。使用ClustalW、Protparam、TMHMM等生物学在线服务器对31个巨桉Ces家族成员进行全面生物信息学分析预测,结果表明:31条蛋白质序列均具有纤维素合酶特征结构域,具有Ces家族成员共有特征;巨桉Ces家族与拟南芥Ces家族、杨树Ces家族的亚族种类、成员组成、蛋白质理化性质方面存在变异性;蛋白质结构和功能相对保守。
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