在中国这样一个人口大国,人地矛盾越来越突出。土地问题解决的好坏直接关系到“三农问题”的解决、“科学发展观”能否较好的贯彻实施与“新农村建设”的顺利开展。而土地承包经营权流转是土地问题中非常重要的一个环节,现阶段土地承包经营权流转从无到有,呈现出:参与主体的多层次性、土地承包经营权流转方式的多样性、涉及行业的广泛性、流转期限长短的不等性、流转的规模不断扩大、速度不断加快和流转的区域存在着相互渗透与扩张等特点。但由于我国还处在社会主义初级阶段,市场经济体制建设与推进和政治、经济、法律、文化等各个方面的改革都必须经历一个渐进和不断完善的过程,因此在土地承包经营权流转中存在着各种障碍。本文在界定土地承包经营权定义与对土地承包经营权流转理论背景进行分析的基础之上,重点阐述和分析土地承包经营权流转中的产权制度障碍、政府职能障碍、市场制度障碍和法律制度障碍,并相应的提出了产权制度改革,政府职能改革、市场体制改革和法律制度改革,以期使土地承包经营权能在相互协商的基础上依法、自愿、有偿的顺利流转;使土地这种稀缺资源达到合理的配置和进一步提高土地资源的利用效率。当然在土地承包经营权流转中还要注意到传统历史文化、人们的思维方式、自然环境因素和各种正式组织与非正式组织的影响。