子宫内膜样腺癌中自噬相关基因及临床预后指标的鉴定与验证

来源 :浙江大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:chenliu2009
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目的:利用TCGA数据库和临床样本对子宫内膜样腺癌(endometrioid endometrial cancer,EEC)中自噬相关基因(autophagy-related genes,ATGs)和临床预后指标展开鉴定与验证。方法:利用TCGA EEC数据集鉴定差异表达的自噬相关基因(differentially expressed autophagy-related genes,DE-ATGs)。使用单因素Cox回归分析从DE-ATGs中筛选预后相关基因。结合临床参数,使用多因素Cox回归分析建立预后风险评分模型。随后,经Kaplan-Meier生存分析和受试者工作特征曲线验证预后预测效果。此外,收集临床标本,其中EEC205例,正常子宫内膜组织45例,使用免疫组化技术验证差异基因的表达情况,分析预后相关基因与其他临床病理参数的相关性。同时,在临床EEC队列中,评估纳入预后风险评分模型中相关参数的独立预后预测效果。结果:基于TCGA-EEC数据集,结合2种ATGs(PTK6和p16)、分期和分级构建了预后风险评分模型,可以可靠地估计EEC患者的生存率。Kaplan-Meier生存分析表明,低风险组的OS高于高风险组(P<0.05),受试者工作特征曲线下的面积为0.818。同时,经免疫组化验证,相比于正常内膜组织,EEC样本中PTK6和p16高表达(P<0.0001)。在EEC临床队列中,PTK6细胞质高表达与深部肌层浸润(P=0.041),淋巴结转移(P=0.005),血清CA153水平升高(P=0.017)相关;p16细胞质高表达与淋巴结转移(P=0.021)相关,且与p53表达水平呈负相关(P=0.014)。经单因素和多因素Cox回归分析显示,细胞质PTK6高表达,癌症晚期和高组织学分级是EEC复发和死亡的独立预测指标(P<0.05)。结论:结合ATGs和临床相关指标在预测EEC预后中具有有效性。PTK6高表达是EEC中一种新型的独立预后生物标志物。
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