【摘 要】
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皮尔逊相关系数（Pearson Correlation Coefficient,PCC）是度量基因间共表达相似性的最广泛使用的方法.但是,由于生物过程的多样性和公共表达数据集的异质性,PCC可能不是最佳的度量共表达的方法.为了获得更好的度量基因间共表达的结果,本文提出了用于共表达的度量学习（Metric Learning for Co-expression,MLC）,这是一种快速算法,可以为每个表
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皮尔逊相关系数（Pearson Correlation Coefficient,PCC）是度量基因间共表达相似性的最广泛使用的方法.但是,由于生物过程的多样性和公共表达数据集的异质性,PCC可能不是最佳的度量共表达的方法.为了获得更好的度量基因间共表达的结果,本文提出了用于共表达的度量学习（Metric Learning for Co-expression,MLC）,这是一种快速算法,可以为每个表达样本分配一个特定的权重.更具体地说,如果用给定基因本体论（Gene Ontology,GO）术语注释两个基因,那么MLC会使它们之间的加权共表达最大化;如果只有一个基因被注释,那么加权共表达将被最小化.在计算所有样本的共表达时,将实验重点放在高权重的样本上,而低权重的样本则会减少对实验的影响.为了验证MLC的性能优越性,使用四种方法分别对公开提供的前列腺癌数据进行共表达度量,并对结果进行比对分析.实验结果证明通过MLC算法加权的共表达度量方法的性能明显优于标准的PCC,进而可以更准确的找出哪些基因在不同条件下完成了相同的生物学过程.
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骨质疏松症是一种进行性的全身骨骼疾病，其发病机制极为复杂。多糖是广泛存在于中药材中的生物大分子，具有多种药理活性。从基因、蛋白、体内外实验等多维度研究综述了中药多糖防治骨质疏松症的作用和机制，总结发现，中药多糖能够通过激活或/和抑制Wnt、磷脂酰肌醇3-激酶（phosphatidylinositol 3-kinase,PI3K）/蛋白激酶B（protein kinase B,Akt）、丝裂原活化蛋
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目的:胃癌是全球最常见的恶性肿瘤之一。2020年我国胃癌新发病例数为47.9万,居我国恶性肿瘤发病的第2位,占全球胃癌新发病例数的43.9%;死亡例数为37.4万,位居我国恶性肿瘤死因的第3位,占全球胃癌死亡病例总数的48.6%。目前,我国胃癌筛查接受度低,患者首次诊断胃癌时多为进展期,预后通常较差。因此我国胃癌患者经手术和化疗后,5年生存率也仅为35.1%。因此,我国的胃癌总体疾病负担十分严峻。