通过叶绿体trnK基因的内含子matK序列及核糖体转录间隔区(ITS)序列研究初步分析了中国原生棕榈科18属间的系统发生。主要结果有以下三点:1)测定了3种中国原生棕榈科植物ITS序列,并通过NCBI网站对GenBank数据库检索得到了部分棕榈科植物ITS序列。结果表明:部分棕榈科植物ITS序列种内差异较大,提示其不同ITS拷贝间没有完全实现同步进化,同种棕榈科植物植物ITS序列差异,有时候大于非同种棕榈植物间差异,这种情况下,由ITS序列构建的棕榈科植物系统树可能是不可信的;2)测定了11种中国原生棕榈科植物matK序列,并通过NCBI网站对GenBank数据库检索得到了其它8种中国原生棕榈科植物matK序列。结果显示,棕榈科植物的matK序列存在一定的信息位点,但是较为保守;3)总的来说,19种样品代表了15属棕榈科植物。通过对其matK序列的聚类分析表明:a)贝叶棕族植物细棕竹及小琼棕与鱼尾葵族鱼尾葵属植物亲缘关系比其同其它贝叶棕族植物亲缘关系近,这与传统分类学对棕榈科植物进行的分类不同;b)刺葵族植物刺葵与贝叶棕族植物亲缘关系较近;c)除桄榔属与鱼尾葵属间分支支持度较低外,其余各分支均大于60%;d)水椰亚科及省藤亚科与其它棕榈科植物见亲缘关系较远,这与以前的研究相一致;e)利用matK序列对棕榈科植物进行系统分类研究与传统分类基本吻合。